Argo_CUDA: Exhaustive GPU based approach for motif discovery in large DNA datasets

Vishnevsky, O. V., Bocharnikov, A. V. & Kolchanov, N. A., 1 февр. 2018, в: Journal of Bioinformatics and Computational Biology. 16, 1, 23 стр., 1740012.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

A Sight on Single-Cell Transcriptomics in Plants Through the Prism of Cell-Based Computational Modeling Approaches: Benefits and Challenges for Data Analysis

Bobrovskikh, A., Doroshkov, A., Mazzoleni, S., Cartenì, F., Giannino, F. & Zubairova, U., 21 мая 2021, в: Frontiers in Genetics. 12, стр. 652974 652974.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › обзорная статья › Рецензирование

A single ChIP-seq dataset is sufficient for comprehensive analysis of motifs co-occurrence with MCOT package

Levitsky, V., Zemlyanskaya, E., Oshchepkov, D., Podkolodnaya, O., Ignatieva, E., Grosse, I., Mironova, V. & Merkulova, T., 2 дек. 2019, в: Nucleic Acids Research. 47, 21, стр. e139 14 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

A software module to assess the metabolic potential of mutant strains of the bacterium Corynebacterium glutamicum

Kazantsev, F. V., Trofimova, M. F., Khlebodarova, T. M., Matushkin, Y. G. & Lashin, S. A., дек. 2024, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 28, 8, стр. 897-903 7 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Assembly and Analysis of Plastomes for 15 Potato Cultivars Grown in Russia

Karetnikov, D. I., Salina, E. A., Kochetov, A. V. & Afonnikov, D. A., июн. 2023, в: Agronomy. 13, 6, 1454.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Assembly and Genome Annotation of Different Strains of Apple Fruit Moth Virus (Cydia pomonella granulovirus)

Лахова, Т. Н., Цыгичко, А., Клименко, А. И., Исмаилов, В., Васильев, Г., Асатурова, А. & Лашин, С. А., июл. 2024, в: International Journal of Molecular Sciences. 25, 13, 7146.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Asymmetric conservation within pairs of co-occurred motifs mediates weak direct binding of transcription factors in chip-seq data

Levitsky, V., Oshchepkov, D., Zemlyanskaya, E. & Merkulova, T., 21 авг. 2020, в: International Journal of Molecular Sciences. 21, 17, стр. 1-22 22 стр., 6023.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Asymmetry of Motif Conservation Within Their Homotypic Pairs Distinguishes DNA-Binding Domains of Target Transcription Factors in ChIP-Seq Data

Levitsky, V. G., Raditsa, V. V., Tsukanov, A. V., Mukhin, A. M., Zhimulev, I. F. & Merkulova, T. I., 4 янв. 2025, в: International Journal of Molecular Sciences. 26, 1, 386.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

A system approach to the modeling of fungal infections of the wheat leaf

Nikolaev, S. V., Zubairova, U. S., Skolotneva, E. S., Orlova, E. A. & Afonnikov, D. A., 1 янв. 2019, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 23, 1, стр. 100-109 10 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

AtSNP_TATAdb: Candidate Molecular Markers of Plant Advantages Related to Single Nucleotide Polymorphisms within Proximal Promoters of Arabidopsis thaliana L.

Bogomolov, A., Zolotareva, K., Filonov, S., Chadaeva, I., Rasskazov, D., Sharypova, E., Podkolodnyy, N., Ponomarenko, P., Savinkova, L., Tverdokhleb, N., Khandaev, B., Kondratyuk, E., Podkolodnaya, O., Zemlyanskaya, E., Kolchanov, N. A. & Ponomarenko, M., янв. 2024, в: International Journal of Molecular Sciences. 25, 1, 607.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование