1. статья › научная › Прошло рецензирование
  2. Global DNA dynamics of 8-oxoguanine repair by human OGG1 revealed by stopped-flow kinetics and molecular dynamics simulation

    Lukina, M. V., Koval, V. V., Lomzov, A. A., Zharkov, D. O. & Fedorova, O. S., 1 окт. 2017, в: Molecular BioSystems. 13, 10, стр. 1954-1966 13 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  3. How human IgGs against myelin basic protein (MBP) recognize oligopeptides and MBP

    Belov, S., Buneva, V. N. & Nevinsky, G. A., 1 окт. 2017, в: Journal of Molecular Recognition. 30, 10, 12 стр., 2637.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  4. Human Tyrosyl-DNA Phosphodiesterase 1 Possesses Transphosphooligonucleotidation Activity With Primary Alcohols

    Dyrkheeva, N., Anarbaev, R., Lebedeva, N., Kuprushkin, M., Kuznetsova, A., Kuznetsov, N., Rechkunova, N. & Lavrik, O., 23 дек. 2020, в: Frontiers in Cell and Developmental Biology. 8, 12 стр., 604732.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  5. Identification of novel inhibitors for the tyrosyl-DNA-phosphodiesterase 1 (Tdp1) mutant SCAN1 using virtual screening

    Mamontova, E. M., Zakharenko, A. L., Zakharova, O. D., Dyrkheeva, N. S., Volcho, K. P., Reynisson, J., Arabshahi, H. J., Salakhutdinov, N. F. & Lavrik, O. I., 1 янв. 2020, в: Bioorganic and Medicinal Chemistry. 28, 1, 11 стр., 115234.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  6. IgGs-abzymes from the sera of patients with systemic lupus erythematosus hydrolyzed miRNAs

    Ermakov, E. A., Kabirova, E. M., Sizikov, A. E., Buneva, V. N. & Nevinsky, G. A., 2020, в: Journal of Inflammation Research. 13, стр. 681-699 19 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  7. Inhibition of tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1 by lipophilic pyrimidine nucleosides

    Zakharenko, A. L., Drenichev, M. S., Dyrkheeva, N. S., Ivanov, G. A., Oslovsky, V. E., Ilina, E. S., Chernyshova, I. A., Lavrik, O. I. & Mikhailov, S. N., 13 авг. 2020, в: Molecules. 25, 16, 13 стр., 3694.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  8. Inhibitory Effect of New Semisynthetic Usnic Acid Derivatives on Human Tyrosyl-DNA Phosphodiesterase 1

    Dyrkheeva, N., Luzina, O., Filimonov, A., Zakharova, O., Ilina, E., Zakharenko, A., Kuprushkin, M., Nilov, D., Gushchina, I., Švedas, V., Salakhutdinov, N. & Lavrik, O., 1 янв. 2019, в: Planta Medica. 85, 2, стр. 103-111 9 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  9. Interaction features of adenine DNA glycosylase MutY from E. coli with DNA substrates

    Tyugashev, T. E., Kuznetsova, A. A., Kuznetsov, N. A. & Fedorova, O. S., 1 янв. 2017, в: Russian Journal of Bioorganic Chemistry. 43, 1, стр. 13-22 10 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  10. Kinetic features of 30-50 exonuclease activity of human AP-endonuclease ape1

    Kuznetsova, A. A., Fedorova, O. S. & Kuznetsov, N. A., 21 авг. 2018, в: Molecules. 23, 9, 14 стр., 2101.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  11. Kinetics and thermodynamics of DNA processing by wild type DNA-glycosylase endo III and its catalytically inactive mutant forms

    Kladova, O. A., Krasnoperov, L. N., Kuznetsov, N. A. & Fedorova, O. S., 30 мар. 2018, в: Genes. 9, 4, 18 стр., 190.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  12. Lesion Recognition and Cleavage of Damage-Containing Quadruplexes and Bulged Structures by DNA Glycosylases

    Kuznetsova, A. A., Fedorova, O. S. & Kuznetsov, N. A., 30 нояб. 2020, в: Frontiers in Cell and Developmental Biology. 8, 16 стр., 595687.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  13. Modulation of the apurinic/apyrimidinic endonuclease activity of human APE1 and of its natural polymorphic variants by base excision repair proteins

    Kladova, O. A., Alekseeva, I. V., Saparbaev, M., Fedorova, O. S. & Kuznetsov, N. A., 1 окт. 2020, в: International Journal of Molecular Sciences. 21, 19, стр. 1-15 15 стр., 7147.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  14. Molecular dynamics simulation of the opposite-base preference and interactions in the active site of formamidopyrimidine-DNA glycosylase

    Popov, A. V., Endutkin, A. V., Vorobjev, Y. N. & Zharkov, D. O., 8 мая 2017, в: BMC Structural Biology. 17, 1, стр. 1-19 19 стр., 5.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  15. Molecular mechanisms of PARP-1 inhibitor 7-methylguanine

    Nilov, D., Maluchenko, N., Kurgina, T., Pushkarev, S., Lys, A., Kutuzov, M., Gerasimova, N., Feofanov, A., Švedas, V., Lavrik, O. & Studitsky, V. M., мар. 2020, в: International Journal of Molecular Sciences. 21, 6, 11 стр., 2159.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  16. Mutational and kinetic analysis of lesion recognition by Escherichia coli endonuclease VIII

    Kladova, O. A., Kuznetsova, A. A., Fedorova, O. S. & Kuznetsov, N. A., 13 мая 2017, в: Genes. 8, 5, 13 стр., 140.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  17. Natural catalytic IgGs hydrolyzing histones in schizophrenia: Are they the link between humoral immunity and inflammation?

    Ermakov, E. A., Parshukova, D. A., Nevinsky, G. A. & Buneva, V. N., 30 сент. 2020, в: International Journal of Molecular Sciences. 21, 19, стр. 1-25 25 стр., 7238.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  18. Neural response to catecholamine depletion in remitted bulimia nervosa: Relation to depression and relapse

    Ermakov, E., Smirnova, L., Ivanova, S., Zaharova, O., Buneva, V. & Nevinsky, G., 1 июл. 2017, в: European Neuropsychopharmacology. 27, 7, стр. 633-646 14 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  19. New Fluorescent Analogs of Nucleotides Based on 3-Hydroxychromone for Recording Conformational Changes of DNA

    Kladova, O. A., Kuznetsova, A. A., Barthes, N. P. F., Michel, B. Y., Burger, A., Fedorova, O. S. & Kuznetsov, N. A., 1 нояб. 2019, в: Russian Journal of Bioorganic Chemistry. 45, 6, стр. 599-607 9 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  20. New hydrazinothiazole derivatives of usnic acid as potent TDP1 inhibitors

    Filimonov, A. S., Chepanova, A. A., Luzina, O. A., Zakharenko, A. L., Zakharova, O. D., Ilina, E. S., Dyrkheeva, N. S., Kuprushkin, M. S., Kolotaev, A. V., Khachatryan, D. S., Patel, J., Leung, I. K. H., Chand, R., Ayine-Tora, D. M., Reynisson, J., Volcho, K. P., Salakhutdinov, N. F. & Lavrik, O. I., 15 окт. 2019, в: Molecules. 24, 20, 3711.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  21. Novel group of tyrosyl-DNA-phosphodiesterase 1 inhibitors based on disaccharide nucleosides as drug prototypes for anti-cancer therapy

    Komarova, A. O., Drenichev, M. S., Dyrkheeva, N. S., Kulikova, I. V., Oslovsky, V. E., Zakharova, O. D., Zakharenko, A. L., Mikhailov, S. N. & Lavrik, O. I., 7 сент. 2018, в: Journal of Enzyme Inhibition and Medicinal Chemistry. 33, 1, стр. 1415-1429 15 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  22. Novel inhibitors of DNA repair enzyme TDP1 combining monoterpenoid and adamantane fragments

    Mozhaitsev, E. S., Zakharenko, A. L., Suslov, E. V., Korchagina, D. V., Zakharova, O. D., Vasil’eva, I. A., Chepanova, A. A., Black, E., Patel, J., Chand, R., Reynisson, J., Leung, I. K. H., Volcho, K. P., Salakhutdinov, N. F. & Lavrik, O. I., 1 янв. 2019, в: Anti-Cancer Agents in Medicinal Chemistry. 19, 4, стр. 463-472 10 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  23. Novel semisynthetic derivatives of bile acids as effective tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1 inhibitors

    Salomatina, O. V., Popadyuk, I. I., Zakharenko, A. L., Zakharova, O. D., Fadeev, D. S., Komarova, N. I., Reynisson, J., Arabshahi, H. J., Chand, R., Volcho, K. P., Salakhutdinov, N. F. & Lavrik, O. I., 17 мар. 2018, в: Molecules. 23, 3, 19 стр., 679.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  24. Novel tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1 inhibitors enhance the therapeutic impact of topoteсan on in vivo tumor models

    Zakharenko, A. L., Luzina, O. A., Sokolov, D. N., Kaledin, V. I., Nikolin, V. P., Popova, N. A., Patel, J., Zakharova, O. D., Chepanova, A. A., Zafar, A., Reynisson, J., Leung, E., Leung, I. K. H., Volcho, K. P., Salakhutdinov, N. F. & Lavrik, O. I., 1 янв. 2019, в: European Journal of Medicinal Chemistry. 161, стр. 581-593 13 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  25. Optimization of nucleosome assembling from histones and model DNAs and estimation of the reconstitution efficiency

    Kutuzov, M. M., Kurgina, T. A., Belousova, E. A., Khodyreva, S. N. & Lavrik, O. I., 1 февр. 2019, в: Biopolymers and Cell. 35, 2, стр. 91-98 8 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  26. PARP-1 Activation Directs FUS to DNA Damage Sites to Form PARG-Reversible Compartments Enriched in Damaged DNA

    Singatulina, A. S., Hamon, L., Sukhanova, M. V., Desforges, B., Joshi, V., Bouhss, A., Lavrik, O. I. & Pastré, D., 7 мая 2019, в: Cell Reports. 27, 6, стр. 1809-1821.e5 18 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  27. Poly(ADP-ribose) polymerases in regulation of DNA repair

    Lavrik, O., 1 янв. 2019, в: Biopolymers and Cell. 35, 3, стр. 182-183 2 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  28. Poly(ADP-ribosyl)ation and DNA repair synthesis in the extracts of naked mole rat, mouse, and human cells

    Kosova, A. A., Kutuzov, M. M., Evdokimov, A. N., Ilina, E. S., Belousova, E. A., Romanenko, S. A., Trifonov, V. A., Khodyreva, S. N. & Lavrik, O. I., 15 мая 2019, в: Aging. 11, 9, стр. 2852-2873 22 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  29. Poly(ADP-ribosyl)ation by PARP1: reaction mechanism and regulatory proteins

    Alemasova, E. E. & Lavrik, O. I., 7 мая 2019, в: Nucleic Acids Research. 47, 8, стр. 3811-3827 17 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  30. Pre-steady-state kinetic analysis of damage recognition by human single-strand selective monofunctional uracil-DNA glycosylase SMUG1

    Kuznetsova, A. A., Iakovlev, D. A., Misovets, I. V., Ishchenko, A. A., Saparbaev, M. K., Kuznetsov, N. A. & Fedorova, O. S., 21 нояб. 2017, в: Molecular BioSystems. 13, 12, стр. 2638-2649 12 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  31. Pre-steady state kinetics of DNA binding and abasic site hydrolysis by tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1

    Kuznetsov, N. A., Lebedeva, N. A., Kuznetsova, A. A., Rechkunova, N. I., Dyrkheeva, N. S., Kupryushkin, M. S., Stetsenko, D. A., Pyshnyi, D. V., Fedorova, O. S. & Lavrik, O. I., 18 авг. 2017, в: Journal of Biomolecular Structure and Dynamics. 35, 11, стр. 2314-2327 14 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  32. Processing of the abasic sites clustered with the benzo[a]pyrene adducts by the base excision repair enzymes

    Starostenko, L. V., Rechkunova, N. I., Lebedeva, N. A., Lomzov, A. A., Koval, V. V. & Lavrik, O. I., 1 февр. 2017, в: DNA Repair. 50, стр. 43-53 11 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  33. Production of abzymes in th, cba, and c57bl/6 mice before and after mog treatment: Comparing changes in cell differentiation and proliferation

    Aulova, K. S., Urusov, A. E., Toporkova, L. B., Sedykh, S. E., Shevchenko, Y. A., Tereshchenko, V. P., Sennikov, S. V., Budde, T., Meuth, S. G., Popova, N. A., Orlovskaya, I. A. & Nevinsky, G. A., янв. 2020, в: Biomolecules. 10, 1, 24 стр., 53.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  34. Production, purification of the recombinant analog of y-box-binding protein 1 and its interaction with poly(ADP-ribose), RNA, single- and double-stranded DNAs

    Alemasova, E. E., Naumenko, K. N., Pestryakov, P. E. & Lavrik, O. I., 2017, в: Biopolymers and Cell. 33, 3, стр. 214-220 7 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  35. Promising new inhibitors of tyrosyl-DNA phosphodiesterase I (Tdp 1) combining 4- arylcoumarin and monoterpenoid moieties as components of complex antitumor therapy

    Khomenko, T. M., Zakharenko, A. L., Chepanova, A. A., Ilina, E. S., Zakharova, O. D., Kaledin, V. I., Nikolin, V. P., Popova, N. A., Korchagina, D. V., Reynisson, J., Chand, R., Ayine-tora, D. M., Patel, J., Leung, I. K. H., Volcho, K. P., Salakhutdinov, N. F. & Lavrik, O. I., 1 янв. 2020, в: International Journal of Molecular Sciences. 21, 1, 21 стр., 126.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  36. p-Toluenesulfonic acid mediated one-pot cascade synthesis and cytotoxicity evaluation of polyfluorinated 2-aryl-2,3-dihydroquinolin-4-ones and their derivatives

    Politanskaya, L., Rybalova, T., Zakharova, O., Nevinsky, G. & Tretyakov, E., 1 июл. 2018, в: Journal of Fluorine Chemistry. 211, стр. 129-140 12 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  37. Purified horse milk exosomes contain an unpredictable small number of major proteins

    Sedykh, S. E., Purvinish, L. V., Monogarov, A. S., Burkova, E. E., Grigor'eva, A. E., Bulgakov, D. V., Dmitrenok, P. S., Vlassov, V. V., Ryabchikova, E. I. & Nevinsky, G. A., 1 июн. 2017, в: Biochimie Open. 4, стр. 61-72 12 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  38. Regulation of poly(ADP-Ribose) polymerase 1 activity by Y-Box-binding protein 1

    Naumenko, K. N., Sukhanova, M. V., Hamon, L., Kurgina, T. A., Alemasova, E. E., Kutuzov, M. M., Pastré, D. & Lavrik, O. I., 16 сент. 2020, в: Biomolecules. 10, 9, стр. 1-26 26 стр., 1325.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  39. Replication protein A as a modulator of the poly(ADP-ribose)polymerase 1 activity

    Maltseva, E. A., Krasikova, Y. S., Sukhanova, M. V., Rechkunova, N. I. & Lavrik, O. I., 1 дек. 2018, в: DNA Repair. 72, стр. 28-38 11 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  40. Role of Arg243 and His239 Residues in the Recognition of Damaged Nucleotides by Human Uracil-DNA Glycosylase SMUG1

    Iakovlev, D. A., Alekseeva, I. V., Kuznetsov, N. A. & Fedorova, O. S., 1 мая 2020, в: Biochemistry (Moscow). 85, 5, стр. 594-603 10 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  41. Role of Ionizing Amino Acid Residues in the Process of DNA Binding by Human AP Endonuclease 1 and in Its Catalysis

    Alekseeva, I. V., Bakman, A. S., Vorobjev, Y. N., Fedorova, O. S. & Kuznetsov, N. A., 14 нояб. 2019, в: Journal of Physical Chemistry B. 123, 45, стр. 9546-9556 11 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  42. Roles of Active-Site Amino Acid Residues in Specific Recognition of DNA Lesions by Human 8-Oxoguanine-DNA Glycosylase (OGG1)

    Tyugashev, T. E., Vorobjev, Y. N., Kuznetsova, A. A., Lukina, M. V., Kuznetsov, N. A. & Fedorova, O. S., 13 июн. 2019, в: Journal of Physical Chemistry B. 123, 23, стр. 4878-4887 10 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  43. RPA and XPA interaction with DNA structures mimicking intermediates of the late stages in nucleotide excision repair

    Krasikova, Y. S., Rechkunova, N. I., Maltseva, E. A. & Lavrik, O. I., 10 янв. 2018, в: PLoS ONE. 13, 1, стр. e0190782 20 стр., 0190782.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  44. Search for Modified DNA Sites with the Human Methyl-CpG-Binding Enzyme MBD4

    Yakovlev, D. A., Kuznetsova, A. A., Fedorova, O. S. & Kuznetsov, N. A., 2017, в: Acta Naturae. 9, 1, стр. 26-37 12 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  45. Structural basis for the recognition and processing of DNA containing bulky lesions by the mammalian nucleotide excision repair system

    Evdokimov, A. N., Tsidulko, A. Y., Popov, A. V., Vorobiev, Y. N., Lomzov, A. A., Koroleva, L. S., Silnikov, V. N., Petruseva, I. O. & Lavrik, O. I., 1 янв. 2018, в: DNA Repair. 61, стр. 86-98 13 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  46. Substrate specificity of healthy human sera IgG antibodies with peroxidase and oxydoreductase activities

    Tolmacheva, A. S., Ermakov, E. A., Buneva, V. N. & Nevinsky, G. A., 31 янв. 2018, в: Royal Society Open Science. 5, 1, стр. 171097 13 стр., 171097.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  47. Substrate specificity of human apurinic/apyrimidinic endonuclease APE1 in the nucleotide incision repair pathway

    Kuznetsova, A. A., Matveeva, A. G., Milov, A. D., Vorobjev, Y. N., Dzuba, S. A., Fedorova, O. S. & Kuznetsov, N. A., 30 нояб. 2018, в: Nucleic Acids Research. 46, 21, стр. 11454-11465 12 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  48. Substrate specificity of IgGs with peroxidase and oxidoreductase activities from sera of patients with systemic lupus erythematosus and multiple sclerosis

    Tolmacheva, A. S., Buneva, V. N. & Nevinsky, G. A., 1 дек. 2019, в: Journal of Molecular Recognition. 32, 12, стр. e2807 15 стр., 2807.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  49. Synthesis and evaluation of aryliden- and hetarylidenfuranone derivatives of usnic acid as highly potent Tdp1 inhibitors

    Zakharova, O., Luzina, O., Zakharenko, A., Sokolov, D., Filimonov, A., Dyrkheeva, N., Chepanova, A., Ilina, E., Ilyina, A., Klabenkova, K., Chelobanov, B., Stetsenko, D., Zafar, A., Eurtivong, C., Reynisson, J., Volcho, K., Salakhutdinov, N. & Lavrik, O., 15 авг. 2018, в: Bioorganic and Medicinal Chemistry. 26, 15, стр. 4470-4480 11 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  50. Synthesis and Inhibitory Properties of Imines Containing Monoterpenoid and Adamantane Fragments Against DNA Repair Enzyme Tyrosyl-DNA Phosphodiesterase 1 (Tdp1)

    Zakharenko, A. L., Mozhaitsev, E. S., Suslov, E. V., Korchagina, D. V., Volcho, K. P., Salakhutdinov, N. F. & Lavrik, O. I., 1 июл. 2018, в: Chemistry of Natural Compounds. 54, 4, стр. 672-676 5 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  51. Synthesis of a series of NAD+ analogues, potential inhibitors of PARP 1, using ADP conjugates functionalized at the terminal phosphate group

    Sherstyuk, Y. V., Zakharenko, A. L., Kutuzov, M. M., Sukhanova, M. V., Lavrik, O. I., Silnikov, V. N. & Abramova, T. V., 1 янв. 2017, в: Russian Journal of Bioorganic Chemistry. 43, 1, стр. 76-83 8 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

ID: 3082212