Combining chromosome conformation capture and exome sequencing for simultaneous detection of structural and single-nucleotide variants

Gridina, M., Lagunov, T., Belokopytova, P., Torgunakov, N., Nuriddinov, M., Nurislamov, A., Nazarenko, L. P., Kashevarova, A. A., Lopatkina, M. E., Vasilyev, S., Zuev, A., Belyaeva, E. O., Salyukova, O. A., Cheremnykh, A. D., Sukhanova, N. N., Minzhenkova, M. E., Markova, Z. G., Demina, N. A., Stepanchuk, Y., Khabarova, A., еще 22Yan, A., Valeev, E., Koksharova, G., Grigor’eva, E. V., Kokh, N., Lukjanova, T., Maximova, Y., Musatova, E., Shabanova, E., Kechin, A., Khrapov, E., Boyarskih, U., Ryzhkova, O., Suntsova, M., Matrosova, A., Karoli, M., Manakhov, A., Filipenko, M., Rogaev, E., Shilova, N. V., Lebedev, I. N. & Fishman, V., 7 мая 2025, в: Genome Medicine. 17, 1, стр. 47 47.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

The synergistic antitumor effect of Karanahan technology and in situ vaccination using anti-OX40 antibodies

Ruzanova, V., Proskurina, A., Ritter, G., Dolgova, E., Oshikhmina, S., Kirikovich, S., Levites, E., Efremov, Y., Taranov, O., Ostanin, A., Chernykh, E., Kolchanov, N. & Bogachev, S., 18 апр. 2025, в: Oncology research. 33, 5, стр. 1229-1248 20 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Chromosomal polymorphism in natural populations of Chironomus borokensis Kerkis, Filippova, Shobanov, Gunderina et Kiknadze, 1988 (Diptera, Chironomidae)

Golygina, V. V., Broshkov, A. D. & Ermolaeva, O. V., 15 апр. 2025, в: Comparative Cytogenetics. 19, стр. 51-74 24 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Decomposing the genetic background of chronic back pain

Elgaeva, E. E., Zorkoltseva, I. V., Nostaeva, A. V., Verzun, D. A., Tiys, E. S., Timoshchuk, A. N., Kirichenko, A. V., Svishcheva, G. R., Freidin, M. B., Williams, F. M. K., Suri, P., Aulchenko, Y. S., Axenovich, T. I. & Tsepilov, Y. A., 15 апр. 2025, в: Human Molecular Genetics. 34, 8, стр. 711-725 15 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

A Mendelian randomization study finds no evidence for causal effects of C-reactive protein on chronic pain conditions

Suri, P., Tsepilov, Y. A., Elgaeva, E. E., Williams, F. M. K., Freidin, M. B. & Stanaway, I. B., 1 апр. 2025, в: Pain medicine (Malden, Mass.). 26, 4, стр. 222-224 3 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

IgA nephropathy is associated with Opisthorchis felineus liver fluke infection: Retrospective 5-year analysis of human kidney samples

Kovner, A., Kapushchak, Y., Hadieva, E., Persidskij, M. & Pakharukova, M., 2 февр. 2025, в: Tropical Medicine and International Health. 30, 4, стр. 292-302 11 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Transcriptome analysis reveals significant discrepancies between two in vitro models of host-trematode interaction

Lishai, E. A., Ponomarev, D. V., Zaparina, O. G. & Pakharukova, M. Y., 30 янв. 2025, в: Acta Tropica. 262, стр. 107534 107534.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Ad6-Based GM-CSF Expressing Vector Displays Oncolytic and Immunostimulatory Effects in an Immunocompetent Syrian Hamster Model of Cholangiocarcinoma

Zabelina, D. S., Osipov, I. D., Maslov, D. E., Kovner, A. V., Vasikhovskaia, V. A., Demina, D. S., Romanov, S. E., Shishkina, E. V., Davydova, J., Netesov, S. V. & Romanenko, M. V., 24 янв. 2025, в: Viruses. 17, 2, 162.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Targeted correction of megabase-scale CNTN6 duplication in induced pluripotent stem cells and impacts on gene expression

Gridina, M., Orlova, P. & Serov, O., 20 янв. 2025, в: PeerJ. 13, 1, e18567.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Ultrastructural organization of the liver of rat pups in early postnatal ontogenesis when pregnant and lactating rats are kept on a low-protein diet

Pershina, E. G., Morozova, K. N. & Bgatova, N. P., 2 янв. 2025, в: Ultrastructural Pathology. 49, 1, стр. 93-107 15 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

The association of lumbar intervertebral disc degeneration with low back pain is modified by underlying genetic propensity to pain

Suri, P., Naeini, M. K., Heagerty, P. J., Freidin, M. B., Smith, I. G., Elgaeva, E. E., Compte, R., Tsepilov, Y. A. & Williams, F. M. K., янв. 2025, в: Spine Journal. 25, 1, стр. 8-17 10 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Molecular phylogenetic analysis and taxonomy of the Palearctic Pamphagidae grasshoppers (Orthoptera, Acridoidea) based on DNA markers

Sukhikh, I., Bugrov, A., Chobanov, D., Fet, V., Biryukov, M. & Blinov, A., 2025, в: Insect Systematics and Evolution. 13 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Changes in the Phenotype and Metabolism of Peritoneal Macrophages in Mucin-2 Knockout Mice and Partial Restoration of Their Functions In Vitro After L-Fucose Treatment

Arzhanova, E. L., Makusheva, Y., Pershina, E. G., Medvedeva, S. S. & Litvinova, E. A., 24 дек. 2024, в: International Journal of Molecular Sciences. 26, 1, 113.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Thraustochytrids: Evolution, Ultrastructure, Biotechnology, and Modeling

Menzorov, A. G., Iukhtanov, D. A., Naumenko, L. G., Bobrovskikh, A. V., Zubairova, U. S., Morozova, K. N. & Doroshkov, A. V., 7 дек. 2024, в: International Journal of Molecular Sciences. 25, 23, 13172.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › обзорная статья › Рецензирование

Auxin Triggers AHR Pathway Activation in the Auxin-Inducible Degron System in Mammalian Cells

Yunusova, A., Zadorozhnyi, D. & Battulin, N., 1 дек. 2024, в: Biochemistry (Moscow). 89, 12, стр. 2214-2226 13 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Comparative liver transcriptome analysis in hamsters infected with food-borne trematodes Opisthorchis felineus, Opisthorchis viverrini, or Clonorchis sinensis

Лишай, Е. А., Запарина, О. Г., Капущак, Я. К., Sripa, B., Hong, S-J., Cheng, G. & Пахарукова, М. Ю., 1 дек. 2024, в: PLoS neglected tropical diseases. 18, 12, 24 стр., e0012685.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Accumulation of Anthocyanin in the Aleurone of Barley Grains by Targeted Restoration of the MYC2 Gene

Egorova, A. A., Zykova, T. E., Hertig, C. W., Hoffie, I., Morozov, S. V., Chernyak, E. I., Rogachev, A. D., Korotkova, A. M., Vikhorev, A. V., Vasiliev, G. V., Shoeva, O. Y., Kumlehn, J., Gerasimova, S. V. & Khlestkina, E. K., дек. 2024, в: International Journal of Molecular Sciences. 25, 23, 12705.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Species-specific renal and liver responses during infection with food-borne trematodes Opisthorchis felineus, Opisthorchis viverrini, or Clonorchis sinensis

Zaparina, O. G., Kapushchak, Y. K., Lishai, E. A., Hong, S. J., Sripa, B. & Pakharukova, M. Y., дек. 2024, в: PLoS ONE. 19, 12, 19 стр., e0311481.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Structural Analysis of the LZTFL1 Protein by Principal Component Analysis (PCA-seq)

Khegai, I. I., Yu, X. & Efimov, V. M., дек. 2024, в: Russian Journal of Bioorganic Chemistry. 50, 6, стр. 2611-2617 7 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Structural variants in the Epb41l4a locus: TAD disruption and Nrep gene misregulation as hypothetical drivers of neurodevelopmental outcomes

Salnikov, P., Korablev, A., Serova, I., Belokopytova, P., Yan, A., Stepanchuk, Y., Tikhomirov, S. & Fishman, V., дек. 2024, в: Scientific Reports. 14, 1, 8 стр., 5288.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

TAD border deletion at the Kit locus causes tissue-specific ectopic activation of a neighboring gene

Kabirova, E., Ryzhkova, A., Lukyanchikova, V., Khabarova, A., Korablev, A., Shnaider, T., Nuriddinov, M., Belokopytova, P., Smirnov, A., Khotskin, N. V., Kontsevaya, G., Serova, I. & Battulin, N., дек. 2024, в: Nature Communications. 15, 1, 16 стр., 4521.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Loop Extrusion Machinery Impairments in Models and Disease

Ryzhkova, A., Maltseva, E., Battulin, N. & Kabirova, E., 17 нояб. 2024, в: Cells. 13, 22, 1896.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › обзорная статья › Рецензирование

Liver Fluke-Derived Molecules Accelerate Skin Repair Processes in a Mouse Model of Type 2 Diabetes Mellitus

Kovner, A., Kapushchak, Y., Zaparina, O., Ponomarev, D. & Pakharukova, M., 8 нояб. 2024, в: International Journal of Molecular Sciences. 25, 22, 12002.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Reduction in Cold-Induced Sweetening by Cas9 Endonuclease-Mediated Knockout of the POTATO VACUOLAR INVERTASE 1 Gene in the Cultivar ‘Symfonia’

Egorova, A. A., Zykova, T. E., Kostina, N. E., Saboiev, I. A., Koloshina, K. A., Filipenko, E. A., Hoffie, I., Hertig, C., Hiekel, S., Kumlehn, J., Kochetov, A. V. & Gerasimova, S. V., 5 окт. 2024, в: Potato Research. 23 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Characterizing a lethal CAG-ACE2 transgenic mouse model for SARS-CoV-2 infection using Cas9-enhanced nanopore sequencing

Smirnov, A., Nurislamov, A., Koncevaya, G., Serova, I., Kabirova, E., Chuyko, E., Maltceva, E., Savoskin, M., Zadorozhny, D., Svyatchenko, V. A., Protopopova, E. V., Taranov, O. S., Legostaev, S. S., Loktev, V. B., Serov, O. & Battulin, N., окт. 2024, в: Transgenic Research. 33, 5, стр. 453-466 14 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Genotype imputation in human genomic studies

Berdnikova, A. A., Zorkoltseva, I. V., Tsepilov, Y. A. & Elgaeva, E. E., окт. 2024, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 28, 6, стр. 628-639 12 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Main Directions and Factors Determining the Variability of CYTB Amino Acid Sequences in Mountain Voles (Alticola, Rodentia, and Arvicolinae)

Kovaleva, V. Y., Moroldoev, I. V., Litvinov, Y. N., Efimov, K. V. & Efimov, V. M., окт. 2024, в: Contemporary Problems of Ecology. 17, 5, стр. 645-655 11 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Mechanisms of Adaptation of the Hypothalamic-Pituitary-Adrenal Axis in Male Mice in Chronic Social Defeat Stress

Sapronova, A. A., Ryabushkina, Y. A., Kisaretova, P. E. & Bondar, N. P., окт. 2024, в: Neuroscience and Behavioral Physiology. 54, 8, стр. 1289-1297 9 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Crosstalk between BER and NHEJ in XRCC4-Deficient Cells Depending on hTERT Overexpression

Sergeeva, S. V., Loshchenova, P. S., Oshchepkov, D. Y. & Orishchenko, K. E., 27 сент. 2024, в: International Journal of Molecular Sciences. 25, 19, 10405.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Generation and analysis of mouse embryonic stem cells with knockout of the Mcph1 (microcephalin) gene

Yunusova, A. M., Smirnov, A. V., Shnaider, T. A., Pristyazhnuk, I. E., Korableva, S. Y. & Battulin, N. R., 23 сент. 2024, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 28, 5, стр. 487-494 8 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

A potent, broadly neutralizing human monoclonal antibody that efficiently protects hACE2-transgenic mice from infection with the Wuhan, BA.5, and XBB.1.5 SARS-CoV-2 variants

Guselnikov, S. V., Baranov, K. O., Kulemzin, S. V., Belovezhets, T. N., Chikaev, A. N., Murasheva, S. V., Volkova, O. Y., Mechetina, L. V., Najakshin, A. M., Chikaev, N. A., Solodkov, P. P., Sergeeva, M. V., Smirnov, A. V., Serova, I. A., Serov, O. L., Markhaev, A. G., Kononova, Y. V., Alekseev, A. Y., Gulyaeva, M. A., Danilenko, D. M., еще 3Battulin, N. R., Shestopalov, A. M. & Taranin, A. V., 9 авг. 2024, в: Frontiers in Immunology. 15, 8 стр., 1442160.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Reconstruction of a Matrix of Genotypic Correlations between Variants within a Gene for Joint Analysis of Imputed and Sequenced Data

Svishcheva, G. R., Kirichenko, A. V., Belonogova, N. M., Elgaeva, E. E., Tsepilov, Y. A., Zorkoltseva, I. V. & Axenovich, T. I., июл. 2024, в: Russian Journal of Genetics. 60, 7, стр. 969-976 8 стр., 13.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Effects of different types of induced neonatal inflammation on development and behavior of C57BL/6 and BTBR mice

Ryabushkina, Y. A., Ayriyants, K. A., Sapronova, A. A., Mutovina, A. S., Kolesnikova, M. M., Mezhlumyan, E. V., Bondar, N. P. & Reshetnikov, V. V., 1 июн. 2024, в: Physiology and Behavior. 280, 114550.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Antitumor Effects of an Anthocyanin-Rich Grain Diet in a Mouse Model of Lewis Lung Carcinoma

Tikhonova, M. A., Shoeva, O. Y., Tenditnik, M. V., Akopyan, A. A., Litvinova, E. A., Popova, N. A., Amstislavskaya, T. G. & Khlestkina, E. K., июн. 2024, в: International Journal of Molecular Sciences. 25, 11, 5727.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Enrichment of Grain Anthocyanin Content through Marker-Assisted Breeding for Ant1, Ant2 or HvMyc2 Genes in Barley (Hordeum vulgare L.)

Kukoeva, T. V., Molobekova, C. A., Totsky, I. V., Vasiliev, G. V., Pronozin, A. Y., Afonnikov, D. A., Khlestkina, E. K. & Shoeva, O. Y., июн. 2024, в: Agronomy. 14, 6, 1231.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Lectotypification of Macromia pyramidalis Martin, 1907 (Odonata: Macromiidae) and its nomenclatural consequences

Kosterin, O. E. & Delfosse, E., 3 мая 2024, в: Zootaxa. 5447, 1, стр. 145-150 6 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Age Prediction Using DNA Methylation Heterogeneity Metrics

Karetnikov, D. I., Romanov, S. E., Baklaushev, V. P. & Laktionov, P. P., мая 2024, в: International Journal of Molecular Sciences. 25, 9, 16 стр., 4967.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

A HGF Mutation in the Familial Case of Primary Lymphedema: A Report

Koksharova, G., Kokh, N., Gridina, M., Khapaev, R., Nimaev, V. & Fishman, V., мая 2024, в: International Journal of Molecular Sciences. 25, 10, 5464.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Assessing cell lines with inducible depletion of cohesin and condensins components through analysis of metaphase chromosome morphology

Yunusova, A. M., Smirnov, A. V., Pristyazhnuk, I. E., Shnaider, T. A., Maltseva, E. K., Afonnikova, S. D., Gusev, O. A. & Battulin, N. R., апр. 2024, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 28, 2, стр. 138-147 10 стр., 2.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Modification of the Hi-C Technology for Molecular Genetic Analysis of Formalin-Fixed Paraffin-Embedded Sections of Tumor Tissues

Gridina, M. M., Stepanchuk, Y. K., Nurridinov, M. A., Lagunov, T. A., Torgunakov, N. Y., Shadsky, A. A., Ryabova, A. I., Vasiliev, N. V., Vtorushin, S. V., Gerashchenko, T. S., Denisov, E. V., Travin, M. A., Korolev, M. A. & Fishman, V. S., апр. 2024, в: Biochemistry (Moscow). 89, 4, стр. 637-652 16 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Role of sirtuins in epigenetic regulation and aging control

Samoilova, E. M., Romanov, S. E., Chudakova, D. A. & Laktionov, P. P., апр. 2024, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 28, 2, стр. 215-227 13 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Towards Development of the 4C-Based Method Detecting Interactions of Plasmid DNA with Host Genome

Yan, A. P., Salnikov, P. A., Gridina, M. M., Belokopytova, P. S. & Fishman, V. S., апр. 2024, в: Biochemistry (Moscow). 89, 4, стр. 653-662 10 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

A case report of Pallister-Killian syndrome with an unusual mosaic supernumerary marker chromosome 12 with interstitial 12p13.1-p12.1 duplication

Karamysheva, T. V., Lebedev, I. N., Minaycheva, L. I., Nazarenko, L. P., Kashevarova, A. A., Fedotov, D. A., Skryabin, N. A., Lopatkina, M. E., Cheremnykh, A. D., Fonova, E. A., Nikitina, T. V., Sazhenova, E. A., Skleimova, M. M., Kolesnikov, N. A., Drozdov, G. V., Yakovleva, Y. S., Seitova, G. N., Orishchenko, K. E. & Rubtsov, N. B., мар. 2024, в: Frontiers in Genetics. 15, 1331066.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование