3DGenBench: a web-server to benchmark computational models for 3D Genomics

Belokopytova, P., Viesná, E., Chiliński, M., Qi, Y., Salari, H., Di Stefano, M., Esposito, A., Conte, M., Chiariello, A. M., Teif, V. B., Plewczynski, D., Zhang, B., Jost, D. & Fishman, V., 5 июл. 2022, в: Nucleic Acids Research. 50, W1, стр. W4-W12

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Accurate noise-robust classification of Bacillus species from MALDI-TOF MS spectra using a denoising autoencoder

Uvarova, Y. E., Demenkov, P. S., Kuzmicheva, I. N., Venzel, A. S., Mischenko, E. L., Ivanisenko, T. V., Efimov, V. M., Bannikova, S. V., Vasilieva, A. R., Ivanisenko, V. A. & Peltek, S. E., 1 сент. 2023, в: Journal of integrative bioinformatics. 20, 3, 12 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

A Cre-LoxP-based approach for combinatorial chromosome rearrangements in human HAP1 cells

Khabarova, A., Koksharova, G., Salnikov, P., Belokopytova, P., Mungalov, R., Pristyazhnuk, I., Nurislamov, A., Gridina, M. & Fishman, V., 26 февр. 2023, в: Chromosome Research. 31, 1, 15 стр., 11.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

A hypomorphic mutation in the mouse Csn1s1 gene generated by CRISPR/Cas9 pronuclear microinjection

Smirnov, A. V., Shnaider, T., Korablev, A. N., Yunusova, A. M., Serova, I. A. & Battulin, N. R., мар. 2021, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 25, 3, стр. 331-336 6 стр., 10.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Anopheles mosquitoes reveal new principles of 3D genome organization in insects

Lukyanchikova, V., Nuriddinov, M., Belokopytova, P., Taskina, A., Liang, J., Reijnders, M. J. M. F., Ruzzante, L., Feron, R., Waterhouse, R. M., Wu, Y., Mao, C., Tu, Z., Sharakhov, I. V. & Fishman, V., дек. 2022, в: Nature Communications. 13, 1, 1960.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

A Novel Framework for Analysis of the Shared Genetic Background of Correlated Traits

Svishcheva, G. R., Tiys, E. S., Elgaeva, E. E., Feoktistova, S. G., Timmers, P. R. H. J., Sharapov, S. Z., Axenovich, T. I. & Tsepilov, Y. A., окт. 2022, в: Genes. 13, 10, 1694.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

A protocol for recruiting and analyzing the disease-oriented Russian disc degeneration study (RuDDS) biobank for functional omics studies of lumbar disc degeneration

Leonova, O. N., Elgaeva, E. E., Golubeva, T. S., Peleganchuk, A. V., Krutko, A. V., Aulchenko, Y. S. & Tsepilov, Y. A., мая 2022, в: PLoS ONE. 17, 5, e0267384.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Bidirectional Mendelian Randomization study of personality traits reveals a positive feedback loop between neuroticism and back pain

Elgaeva, E. E., Williams, F. M. K., Zaytseva, O. O., Freidin, M. B., Aulchenko, Y. S., Suri, P. & Tsepilov, Y. A., окт. 2023, в: The journal of pain. 24, 10, стр. 1875-1885 11 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Candidate genes for age at menarche are associated with endometriosis

Ponomarenko, I., Reshetnikov, E., Polonikov, A., Verzilina, I., Sorokina, I., Elgaeva, E. E., Tsepilov, Y. A., Yermachenko, A., Dvornyk, V. & Churnosov, M., нояб. 2020, в: Reproductive BioMedicine Online. 41, 5, стр. 943-956 14 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Causal effects of psychosocial factors on chronic back pain: a bidirectional Mendelian randomisation study

Williams, F. M. K., Elgaeva, E. E., Freidin, M. B., Zaytseva, O. O., Aulchenko, Y. S., Tsepilov, Y. A. & Suri, P., июл. 2022, в: European Spine Journal. 31, 7, стр. 1906-1915 10 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Cell Dynamics in WOX5-Overexpressing Root Tips: The Impact of Local Auxin Biosynthesis

Savina, M. S., Pasternak, T., Omelyanchuk, N. A., Novikova, D. D., Palme, K., Mironova, V. V. & Lavrekha, V. V., 22 окт. 2020, в: Frontiers in Plant Science. 11, 13 стр., 560169.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Cell type-specific interpretation of noncoding variants using deep learning-based methods

Sindeeva, M., Chekanov, N., Avetisian, M., Shashkova, T. I., Baranov, N., Malkin, E., Lapin, A., Kardymon, O. & Fishman, V., 20 мар. 2023, в: GigaScience. 12, стр. 1-11 11 стр., giad015.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

CisCross: A gene list enrichment analysis to predict upstream regulators in Arabidopsis thaliana

Lavrekha, V. V., Levitsky, V. G., Tsukanov, A. V., Bogomolov, A. G., Grigorovich, D. A., Omelyanchuk, N., Ubogoeva, E. V., Zemlyanskaya, E. V. & Mironova, V., 18 авг. 2022, в: Frontiers in Plant Science. 13, 942710.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Comparison and critical assessment of single-cell Hi-C protocols

Gridina, M., Taskina, A., Lagunov, T., Nurislamov, A., Kulikova, T., Krasikova, A. & Fishman, V., окт. 2022, в: Heliyon. 8, 10, 6 стр., e11023.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Composition of bacterial microbiome in sputum of patients with localized forms of pulmonary tuberculosis

Druzhinin, V. G., Baranova, E. D., Demenkov, P. S., Zakharova, J. V., Lavryashina, M. B., Larionov, A. V., Matskova, L. V., Shabaldin, A. V. & Pyanzova, T. V., 2023, в: Pulmonologiya. 33, 5, стр. 645-656 12 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

DyCeModel: a tool for 1D simulation for distribution of plant hormones controlling tissue patterning

Azarova, D. S., Omelyanchuk, N. A., Mironova, V. V., Zemlyanskaya, E. V. & Lavrekha, V. V., дек. 2023, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 27, 7, стр. 890-897 8 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Erythrocytes 3D genome organization in vertebrates

Ryzhkova, A., Taskina, A., Khabarova, A., Fishman, V. & Battulin, N., февр. 2021, в: Scientific Reports. 11, 1, 4414.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Evaluation of the α-casein (CSN1S1) locus as a potential target for a site-specific transgene integration

Smirnov, A. V., Kontsevaya, G. V., Shnaider, T. A., Yunusova, A. M., Feofanova, N. A., Gerlinskaya, L. A., Serova, I. A., Serov, O. L. & Battulin, N. R., дек. 2022, в: Scientific Reports. 12, 1, 7983.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Evidence of causal effects of blood pressure on back pain and back pain on type II diabetes provided by a bidirectional Mendelian randomization study

Suri, P., Elgaeva, E. E., Williams, F. M. K., Freidin, M. B., Zaytseva, O. O., Aulchenko, Y. S. & Tsepilov, Y. A., авг. 2023, в: Spine Journal. 23, 8, стр. 1161-1171 11 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Expanding the list of sequence-agnostic enzymes for chromatin conformation capture assays with S1 nuclease

Maria, G., Andrey, P., Artem, S., Nikita, T., Andrey, K., Evgeny, K., Oxana, R., Maxim, F. & Veniamin, F., 11 дек. 2023, в: Epigenetics & chromatin. 16, 1, 13 стр., 48.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование