51 - 100 out of 174Page size: 50
  1. 2023

  2. Correlated Target Search by Vaccinia Virus Uracil-DNA Glycosylase, a DNA Repair Enzyme and a Processivity Factor of Viral Replication Machinery

    Diatlova, E. A., Mechetin, G. V., Yudkina, A. V., Zharkov, V. D., Torgasheva, N. A., Endutkin, A. V., Shulenina, O. V., Konevega, A. L., Gileva, I. P., Shchelkunov, S. N. & Zharkov, D. O., 23 May 2023, In: International Journal of Molecular Sciences. 24, 11, 9113.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  3. Activity of nsp14 Exonuclease from SARS-CoV-2 towards RNAs with Modified 3'-Termini

    Yuyukina, S. K., Barmatov, A. E., Bizyaev, S. N., Stetsenko, D. A., Sergeeva, O. V., Zatsepin, T. S. & Zharkov, D. O., Apr 2023, In: Doklady. Biochemistry and biophysics. 509, 1, p. 65-69 5 p.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  4. Factors Affecting the Stability of the Trimer of 2'-Deoxyuridine 5'-Triphosphate Nucleotide Hydrolase from Escherichia coli

    Yudkina, A. V., Kovalenko, E. A., Endutkin, A. V., Panferova, E. P., Kirilenko, A. A., Kokhanenko, A. A. & Zharkov, D. O., Apr 2023, In: Molecular Biology. 57, 2, p. 312-319 8 p.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  5. Mechanisms of the Specificity of the CRISPR/Cas9 System in Genome Editing

    Kulishova, L. M., Vokhtantsev, I. P., Kim, D. V. & Zharkov, D. O., Apr 2023, In: Molecular Biology. 57, 2, p. 258-271 14 p.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  6. Dynamics of 8-Oxoguanine in DNA: Decisive Effects of Base Pairing and Nucleotide Context

    Ovcherenko, S. S., Shernyukov, A. V., Nasonov, D. M., Endutkin, A. V., Zharkov, D. O. & Bagryanskaya, E. G., 15 Mar 2023, In: Journal of the American Chemical Society. 145, 10, p. 5613-5617 5 p.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  7. Факторы, влияющие на стабильность тримерной формы 2'-дезоксиуридин-5'-трифосфатнуклеотидгидролазы Escherichia coli

    Yudkina, A. V., Kovalenko, E. A., Endutkin, A. V., Panferova, E. P., Kirilenko, A. A., Kokhanenko, A. A. & Zharkov, D. O., 1 Mar 2023, In: Molekuliarnaia biologiia. 57, 2, p. 330-339 10 p., 17.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  8. Pan-cancer antagonistic inhibition pattern of ATM-driven G2/M checkpoint pathway vs other DNA repair pathways

    Zolotovskaia, M. A., Modestov, A. A., Suntsova, M. V., Rachkova, A. A., Koroleva, E. V., Poddubskaya, E. V., Sekacheva, M. I., Tkachev, V. S., Garazha, A. V., Glusker, A. A., Seryakov, A. P., Vladimirova, U. S., Rumiantsev, P. O., Moisseev, A. A., Zharkov, D. O., Kuzmin, D. V., Zhao, X., Prassolov, V. S., Shegay, P. V., Li, X., & 5 othersSteinbichler, T. B., Kim, E., Sorokin, M. I., Wang, Y. & Buzdin, A. A., Mar 2023, In: DNA Repair. 123, 18 p., 103448.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  9. DNA Damage Response and Repair in Boron Neutron Capture Therapy

    Mechetin, G. V. & Zharkov, D. O., 2 Jan 2023, In: Genes. 14, 1, 127.

    Research output: Contribution to journal › Review article › peer-review

  10. Structural Biology in the Study of Enzyme Catalysis: An Example of DNA Glycosylases

    Жарков, Д. О., 2023, SYNCHROTRON RADIATION TECHNIQUES FOR CATALYSTS AND FUNCTIONAL MATERIALS: II International Conference, Abstracts. Новосибирск: Издательский отдел Института катализа СО РАН, p. 18 1 p.

    Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceeding › Conference contribution › Research › peer-review

  11. Активность ДНК-гликозилах на неканонических структурах ДНК

    Дятлова, Е. А., Ерошенко, Д. А. & Жарков, Д. О., 2023, БИОКАТАЛИЗ. ФУНДАМЕНТАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ И ПРИМЕНЕНИЯ. Москва: ООО "АДМИРАЛ ПРИНТ", p. 70 1 p.

    Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceeding › Conference contribution › Research › peer-review

  12. Альтернативные механизмы мутагенеза в mCpG-сайтах при репликации и репарации

    Shilkin, E. S., Petrova, D. V., Zharkov, D. O. & Makarova, A. V., 2023, In: Molekuliarnaia biologiia. 57, 4, p. 587-596 10 p., 3.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  13. Анализ активности и специфичности рационально сконструированных вариантов белка CAS9 ИЗ Streptococcus pyogenes

    Вохтанцев, И. П., Кадцын, Е. Д., Аманова, М. М., Бакулина, А. Ю. & Жарков, Д. О., 2023, БИОКАТАЛИЗ. ФУНДАМЕНТАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ И ПРИМЕНЕНИЯ: Тезисы докладов 13-ой Международной научной конференции. Москва: ООО "АДМИРАЛ ПРИНТ", p. 57 1 p.

    Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceeding › Conference contribution › Research › peer-review

  14. Биоразнообразие микроорганизмов — источник новых ферментов репарации ДНК

    Жарков, Д. О., 2023, От микробиологии к генетическим технологиям. Новосибирск: ООО "Офсет ТМ", p. 86-87 2 p.

    Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceeding › Conference contribution › Research › peer-review

  15. Влияние окислительного повреждения oxoGна стабильность дуплексов ДНК

    Насонов, Д. М., Овчеренко, С. С., Шернюков, А. В., Ендуткин, А. В., Жарков, Д. О. & Багрянская, Е. Г., 2023, p. 181. 1 p.

    Research output: Contribution to conference › Abstract › peer-review

  16. ДИНАМИКА ОТКРЫТИЯ ПАР ОСНОВАНИЙ OXOG:C И OXOG:A ПО ДАННЫМ МЕТОДИКИ ЯМР ПЕРЕНОСА НАМАГНИЧЕННОСТИ С ВОДЫ

    Овчеренко, С. С., Насонов, Д. М., Шернюков, А. В., Ендуткин, А. В., Жарков, Д. О. & Багрянская, Е. Г., 2023, X МЕЖДУНАРОДНАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ МОЛОДЫХ УЧЕНЫХ: БИОИНФОРМАТИКОВ, БИОТЕХНОЛОГОВ, БИОФИЗИКОВ, ВИРУСОЛОГОВ И МОЛЕКУЛЯРНЫХ БИОЛОГОВ: Сборник тезисов. Новосибирск: ИПЦ НГУ, p. 377-378 2 p.

    Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceeding › Conference contribution › Research › peer-review

  17. Изучение роли C-концевого фрагмента 8-оксогуанин-ДНК-гликозилазы 1 человека (OGG1) в связывании и расщеплении специфических субстратов

    Яковлев, А. О. & Жарков, Д. О., 2023. 1 p.

    Research output: Contribution to conference › Abstract › peer-review

  18. Изучение состояния ионизируемых групп в активном центре комплекса Fpg-ДНК методом ЭПР

    Литвинов, И. А., Овчеренко, С. С., Булгаков, Н. А., Кирилюк, И. А., Жарков, Д. О. & Багрянская, Е. Г., 2023, p. 175. 1 p.

    Research output: Contribution to conference › Abstract › peer-review

  19. Механизм действия ДНК-полимераз на субстратах с модифицированными АП-сайтами

    Юдкина, А. В., Булгаков, Н. А., Шилкин, Е. С., Болдинова, Е. О., Макарова, А. В., Ким, Д. В. & Жарков, Д. О., 2023, БИОКАТАЛИЗ. ФУНДАМЕНТАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ И ПРИМЕНЕНИЯ: Тезисы докладов 13-ой Международной научной конференции. Москва: ООО "АДМИРАЛ ПРИНТ", p. 161 1 p.

    Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceeding › Conference contribution › Research › peer-review

  20. Механизм прохождения модифицированных АП-сайтов ДНК-полимеразами

    Юдкина, А. В. & Жарков, Д. О., 2023, ОТ МИКРОБИОЛОГИИ К ГЕНЕТИЧЕСКИМ ТЕХНОЛОГИЯМ: Материалы всероссийской конференции. Новосибирск: ООО "Офсет ТМ", p. 93 1 p.

    Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceeding › Conference contribution › Research

  21. Механизмы ДНК-гликолилаз и проблема "избыточных реакций"

    Жарков, Д. О., 2023, Биокатализ. Фундаментальные исследования и применения: Тезисы докладов 13-ой Международной научной конференции. Москва: ООО "АДМИРАЛ ПРИНТ", p. 79 1 p.

    Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceeding › Conference contribution › Research › peer-review

  22. Механизмы специфичности системы CRISPR/Cas9 в геномном редактировании

    Kulishova, L. M., Vokhtantsev, I. P., Kim, D. V. & Zharkov, D. O., 2023, In: Molekuliarnaia biologiia. 57, 2, p. 269-284 16 p., 12.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  23. Основы белковой инженерии

    Юдкина, А. В., Петрова, Д. В., Торгашева, Н. А., Вохтанцев, И. П., Дятлова, Е. А., Ендуткин, А. В., Байков, И. К., Дворникова, А. П. & Жарков, Д. О., 2023, (Accepted/In press) Новосибирск: Редакционно-издательский центр НГУ. 181 p.

    Research output: Book/Report › Teaching materials › peer-review

  24. Особенности ответа клеток карциномы легких человека A549 с нокаутированным геном PRIMPOL на генотоксический стресс

    Громова, А. С., Болдинова, Е. О., Ким, Д. В., Чупров-Неточин, Р. Н., Жарков, Д. О., Макарова, А. В., Леонов, С. В. & Пустовалова, М. В., 2023, In: Биохимия. 88, 11, p. 2340-2352 13 p.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  25. Передвижение ферментов репарации по ДНК: in vitro vs in vivo

    Жарков, Д. О. & Дятлова, Е. А., 2023. 1 p.

    Research output: Contribution to conference › Abstract › peer-review

  26. Субстратная специфичность ферментов эксцизионной репарации оснований в отношении искусственных нуклеотидов, применяемых в синтетической биологии

    Ендуткин, А. В., Юдкина, А. В., Барматов, А. Е. & Жарков, Д. О., 2023, БИОКАТАЛИЗ. ФУНДАМЕНТАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ И ПРИМЕНЕНИЯ. Москва: ООО "АДМИРАЛ ПРИНТ", p. 74 1 p.

    Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceeding › Conference contribution › Research › peer-review

  27. Факторы, влияющие на стабильность тримерной формы 2›ДЕЗОКСИУРИДИН-5›-ТРИФОСФАТНУКЛЕОТИДГИДРОЛАЗЫ ESCHERICHIA COLI

    Кириленко, А. А., Коваленко, Е. А., Юдкина, А. В., Ендуткин, А. В., Панфёрова, Е. П., Коханенко, А. А. & Жарков, Д. О., 2023, p. 184-185. 2 p.

    Research output: Contribution to conference › Abstract › peer-review

  28. 2022

  29. Natural Nucleoside Modifications in Guide RNAs Can Modulate the Activity of the CRISPR-Cas9 System In Vitro.

    Prokhorova, D. V., Vokhtantsev, I. P., Tolstova, P. O., Zhuravlev, E. S., Kulishova, L. M., Zharkov, D. O. & Stepanov, G. A., Dec 2022, In: The CRISPR journal. 5, 6, p. 799-812 14 p.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  30. Cloning and characterization of the major AP endonuclease from Staphylococcus aureus

    Turgimbayeva, A., Zein, U., Zharkov, D. O., Ramankulov, Y., Saparbaev, M. & Abeldenov, S., Nov 2022, In: DNA Repair. 119, 10 p., 103390.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  31. Recognition of a Clickable Abasic Site Analog by DNA Polymerases and DNA Repair Enzymes

    Endutkin, A. V., Yudkina, A. V., Zharkov, T. D., Kim, D. V. & Zharkov, D. O., Nov 2022, In: International Journal of Molecular Sciences. 23, 21, 13353.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  32. Distinct Mechanisms of Target Search by Endonuclease VIII-like DNA Glycosylases

    Diatlova, E. A., Mechetin, G. V. & Zharkov, D. O., Oct 2022, In: Cells. 11, 20, 3192.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  33. Mechanisms of Coronavirus Genome Stability As Potential Targets for Antiviral Drugs

    Yuyukina, S. K. & Zharkov, D. O., Aug 2022, In: Herald of the Russian Academy of Sciences. 92, 4, p. 470-478 9 p.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  34. Noncatalytic Domains in DNA Glycosylases

    Torgasheva, N. A., Diatlova, E. A., Grin, I. R., Endutkin, A. V., Mechetin, G. V., Vokhtantsev, I. P., Yudkina, A. V. & Zharkov, D. O., 1 Jul 2022, In: International Journal of Molecular Sciences. 23, 13, 7286.

    Research output: Contribution to journal › Review article › peer-review

  35. Характеристика деметилирующей ДНК-гликозилазы ROS1 из Nicotiana tabacum L

    Петрова, Д. В., Пермякова, Н. В., Грин, И. Р. & Жарков, Д. О., Jul 2022, In: Вавиловский журнал генетики и селекции. 26, 4, p. 341-348 8 p., 1.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  36. Механизмы обеспечения стабильности генома коронавирусов как потенциальные мишени для противовирусных средств

    Ююкина, С. К. & Жарков, Д. О., 14 Mar 2022, In: Вестник РАН. 92, 8, p. 737-746 10 p., 5.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  37. Miscoding and DNA Polymerase Stalling by Methoxyamine-Adducted Abasic Sites

    Yudkina, A. V. & Zharkov, D. O., 21 Feb 2022, In: Chemical Research in Toxicology. 35, 2, p. 303-314 12 p.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  38. A Low-Activity Polymorphic Variant of Human NEIL2 DNA Glycosylase

    Kakhkharova, Z. I., Zharkov, D. O. & Grin, I. R., 1 Feb 2022, In: International Journal of Molecular Sciences. 23, 4, 2212.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  39. Dataset for dynamics and conformational changes in human NEIL2 protein analyzed by integrative structural biology approach

    Zhdanova, P. V., Ishchenko, A. A., Chernonosov, A. A., Zharkov, D. O. & Koval, V. V., Feb 2022, In: Data in Brief. 40, 107760.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  40. Stalling of Eukaryotic Translesion DNA Polymerases at DNA-Protein Cross-Links

    Yudkina, A. V., Shilkin, E. S., Makarova, A. V. & Zharkov, D. O., Feb 2022, In: Genes. 13, 2, 166.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  41. Dynamics and Conformational Changes in Human NEIL2 DNA Glycosylase Analyzed by Hydrogen/Deuterium Exchange Mass Spectrometry

    Zhdanova, P. V., Ishchenko, A. A., Chernonosov, A. A., Zharkov, D. O. & Koval, V. V., 30 Jan 2022, In: Journal of Molecular Biology. 434, 2, 167334.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  42. Effect of DNA Methylation on the 3′→5′ Exonuclease Activity of Major Human Abasic Site Endonuclease APEX1

    Endutkin, A. V., Yatsenko, D. D. & Zharkov, D. O., Jan 2022, In: Biochemistry (Moscow). 87, 1, p. 10-20 11 p., 1.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  43. Base excision repair in non-canonical DNA structures

    Дятлова, Е. А., Ерошенко, Д. А. & Жарков, Д. О., 2022, p. 977-978. 2 p.

    Research output: Contribution to conference › Abstract › peer-review

  44. Bioorthogonality in the light of cell defense mechanisms: Interaction of non-natural nucleic acids with the base excision DNA repair system

    Ендуткин, А. В., Юдкина, А. В. & Жарков, Д. О., 2022, p. 982. 1 p.

    Research output: Contribution to conference › Abstract › peer-review

  45. Interaction of DNA replication and DNA repair systems with AP sites adducts with proteins, peptides and low-molecular-weight compounds

    Юдкина, А. В., Шилкин, Е. С., Болдинова, Е. О., Макарова, А. В., Дворникова, А. П., Булгаков, Н. А., Ким, Д. В. & Жарков, Д. О., 2022, p. 1026. 1 p.

    Research output: Contribution to conference › Abstract › peer-review

  46. Structure and function evolution in DNA repair

    Жарков, Д. О., 2022, p. 1027. 1 p.

    Research output: Contribution to conference › Abstract › peer-review

  47. Transcriptional mutagenesis-based reporter system for the analysis of DNA repair

    Ким, Д. В., Khobta, A. & Жарков, Д. О., 2022, p. 987. 1 p.

    Research output: Contribution to conference › Abstract › peer-review

  48. Влияние метилирования ДНК на 3′→5′-экзонуклеазную активность основной апурин-апиримидиновой эндонуклеазы человека APEX1

    Ендуткин, А. В., Яценко, Д. Д. & Жарков, Д. О., 2022, In: Биохимия. 87, 1, p. 3-15 13 p., 1.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  49. Генотоксичность и механизмы репарации ДНК-пептидных сшивок с АП-сайтами

    Юдкина, А. В., Булгаков, Н. А., Ким, Д. В. & Жарков, Д. О., 2022, p. 728. 1 p.

    Research output: Contribution to conference › Abstract

  50. Ингибиторы ДНК-гликозилаз как потенциальные терапевтические препараты

    Жарков, Д. О., 2022, p. 41. 1 p.

    Research output: Contribution to conference › Abstract › peer-review

  51. Оптимизация неадресующего фрагмента sgРНК для системы геномного редактирования CRISPR/Cas9 методом молекулярной селекции in vitro

    Воробьев, П. Е., Вохтанцев, И. П., Мещанинова, М. И., Кабилов, М. Р., Жарков, Д. О. & Воробьева, М. А., 2022, p. 101. 1 p.

    Research output: Contribution to conference › Abstract › peer-review

  52. Оптимизация экспрессии и тестирования активности ДНК-гликозилазы MUTYH млекопитающих

    Кручинин, А. А., Шилкин, Е. С., Жарков, Д. О. & Макарова, А. В., 2022, p. 125-126. 2 p.

    Research output: Contribution to conference › Abstract

Previous 1 2 3 4 Next

ID: 3458293