Section of Molecular Biology and Biotechnology - Research output

151 - 200 out of 1,081Page size: 50

Sort by: Publication date

2024
A Knockout of Poly(ADP-Ribose) Polymerase 1 in a Human Cell Line: An Influence on Base Excision Repair Reactions in Cellular Extracts
Khodyreva, S. N., Ilina, E. S., Dyrkheeva, N. S., Kochetkova, A. S., Yamskikh, A. A., Maltseva, E. A., Malakhova, A. A., Medvedev, S. P., Zakian, S. M. & Lavrik, O. I., Feb 2024, In: Cells. 13, 4, 302.
Research output: Contribution to journal › Article › peer-review
ICTV Virus Taxonomy Profile: Filoviridae 2024
Biedenkopf, N., Bukreyev, A., Chandran, K., Di Paola, N., Formenty, P. B. H., Griffiths, A., Hume, A. J., Mühlberger, E., Netesov, S. V., Palacios, G., Pawęska, J. T., Smither, S., Takada, A., Wahl, V. & Kuhn, J. H., Feb 2024, In: Journal of General Virology. 105, 2, 2 p., 001955.
Research output: Contribution to journal › Article › peer-review
Sterile Fecal Microbiota Transplantation Boosts Anti-Inflammatory T-Cell Response in Ulcerative Colitis Patients
Chechushkov, A., Desyukevich, P., Yakovlev, T., Al Allaf, L., Shrainer, E., Morozov, V. & Tikunova, N., Feb 2024, In: International Journal of Molecular Sciences. 25, 3, 1886.
Research output: Contribution to journal › Article › peer-review
The Influence of Platinum Additives on the Activity and Stability of Rh-Containing Catalyst for the Conversion of Diesel Fuel into Synthesis Gas
Shilov, V. A., Burmatova, M. A., Belyaev, V. D., Potemkin, D. I. & Snytnikov, P. V., Feb 2024, In: Kinetics and Catalysis. 65, 1, p. 66-74 9 p.
Research output: Contribution to journal › Article › peer-review
8-Oxoadenine: A «New» Player of the Oxidative Stress in Mammals?
Kruchinin, A. A., Kamzeeva, P. N., Zharkov, D. O., Aralov, A. V. & Makarova, A. V., 22 Jan 2024, In: International Journal of Molecular Sciences. 25, 2, 1342.
Research output: Contribution to journal › Review article › peer-review
A non-canonical nucleotide from viral genomes interferes with the oxidative DNA damage repair system
Yudkina, A. V., Endutkin, A. V., Diatlova, E. A. & Zharkov, D. O., Jan 2024, In: DNA Repair. 133, 8 p., 103605.
Research output: Contribution to journal › Article › peer-review
Back-Up Base Excision DNA Repair in Human Cells Deficient in the Major AP Endonuclease, APE1
Kim, D. V., Diatlova, E. A., Zharkov, T. D., Melentyev, V. S., Yudkina, A. V., Endutkin, A. V. & Zharkov, D. O., Jan 2024, In: International Journal of Molecular Sciences. 25, 1, 64.
Research output: Contribution to journal › Article › peer-review
Coordination between human DNA polymerase β and apurinic/apyrimidinic endonuclease 1 in the course of DNA repair
Bakman, A. S., Boichenko, S. S., Kuznetsova, A. A., Ishchenko, A. A., Saparbaev, M. & Kuznetsov, N. A., Jan 2024, In: Biochimie. 216, p. 126-136 11 p.
Research output: Contribution to journal › Article › peer-review
Substrate Specificity Diversity of Human Terminal Deoxynucleotidyltransferase May Be a Naturally Programmed Feature Facilitating Its Biological Function
Kuznetsova, A. A., Senchurova, S. I., Gavrilova, A. A., Tyugashev, T. E., Mikushina, E. S. & Kuznetsov, N. A., Jan 2024, In: International Journal of Molecular Sciences. 25, 2, 879.
Research output: Contribution to journal › Article › peer-review
The Effectiveness of Co-Inoculation by Consortia of Microorganisms Depends on the Type of Plant and the Soil Microbiome
Sokolova, E. A., Mishukova, O. V., Hlistun, I. V., Tromenschleger, I. N., Tikunov, A. Y., Manakhov, A. D., Rogaev, E. I., Savenkov, O. A., Buyanova, M. D., Ivanov, I. V., Smirnova, N. V. & Voronina, E. N., Jan 2024, In: Plants. 13, 1, 116.
Research output: Contribution to journal › Article › peer-review
The Role of Key Amino Acids of the Human Fe(II)/2OG-Dependent Dioxygenase ALKBH3 in Structural Dynamics and Repair Activity toward Methylated DNA
Kanazhevskaya, L. Y., Gorbunov, A. A., Lukina, M. V., Smyshliaev, D. A., Zhdanova, P. V., Lomzov, A. A. & Koval, V. V., Jan 2024, In: International Journal of Molecular Sciences. 25, 2, 1145.
Research output: Contribution to journal › Article › peer-review
Aberrant Repair of 8-Oxoguanine in Short DNA Bulges
Eroshenko, D. A., Diatlova, E. A., Golyshev, V. M., Endutkin, A. V. & Zharkov, D. O., 2024, In: Doklady. Biochemistry and biophysics. 513, Suppl 1, p. S82-S86 5 p.
Research output: Contribution to journal › Article › peer-review
A comparison of two approaches for autosomal recessive diseases carrier screening
Sotnikova, E. A., Kiseleva, A. V., Kutsenko, V. A., Soplenkova, A., Zharikova, A. A., Ramensky, V. E., Вяткин, Ю. В., Ershova, A. I., Skirko, O. P., Zaicenoka, M., Pokrovskaya, M. S., Shalnova, S. A., Drapkina, O. M. & Meshkov, A. N., 2024, In: European journal of human genetics. 32, S1, p. 287 1 p., EP17.007.
Research output: Contribution to journal › Conference article › peer-review
Analysis of critical amino acid residues in the active center of a novel DNA glycosylase Fpg-like protein 1 Streptomyces coelicolor superfamily “helix-2-turn-helix” DNA glycosylase
Булгаков, Н. А., Юдкина, А. В., Жарков, Д. О. & Garcia-Diaz, M., 2024, BIOINFORMATICS OF GENOME REGULATION AND STRUCTURE / SYSTEMS BIOLOGY: Abstracts of the Fourteenth International Multiconference. Новосибирск: Институт цитологии и генетики СО РАН, p. 1971-1972 2 p.
Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceeding › Conference contribution › Research
Bacteriophage Treatment of Infected Diabetic Foot Ulcers
Morozova, V. V., Kozlova, Y. N., Ganichev, D. A. & Tikunova, N. V., 2024, Methods in Molecular Biology. Azeredo, J. & Sillankorva, S. (eds.). 2 ed. Humana Press, Vol. 2734. p. 197-205 9 p. (Methods in Molecular Biology; vol. 2734).
Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceeding › Chapter › Research › peer-review
Robust and Reproducible Protocol for Phage Genome "Rebooting" Using Transformation-Associated Recombination (TAR) Cloning into Yeast Centromeric Plasmid
Baykov, I., Kurchenko, O., Mikhaylova, E., Morozova, V. V. & Tikunova, N. V., 2024, Methods in Molecular Biology. Azeredo, J. & Sillankorva, S. (eds.). 2 ed. Humana Press, Vol. 2734. p. 301-317 17 p. (Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)).
Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceeding › Chapter › Research › peer-review
Successful Use of Phage and Antibiotics Therapy for the Eradication of Two Bacterial Pathogens from the Respiratory Tract of an Infant
Morozova, V. V., Kozlova, Y. N. & Tikunova, N. V., 2024, Methods in Molecular Biology. Azeredo, J. & Sillankorva, S. (eds.). 2 ed. Humana Press, Vol. 2734. p. 237-243 7 p. (Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)).
Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceeding › Chapter › Research › peer-review
The approaches for CRISPR/Cas9 regulation on the guide RNA level
Новопашина, Д. С., Саковина, Л. В., Горленко, Е. С., Должикова, О. А. & Мещанинова, М. И., 2024, BIOINFORMATICS OF GENOME REGULATION AND STRUCTURE / SYSTEMS BIOLOGY: Abstracts of the Fourteenth International Multiconference. Новосибирск: Институт цитологии и генетики СО РАН, p. 1724 1 p.
Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceeding › Conference contribution › Research
Антибиотики
Кузнецов, Н. А. & Булыгин, А. А., 2024, Новосибирск: ИПЦ НГУ. 78 p.
Research output: Book/Report › Teaching materials › peer-review
Биологическая активность почвенных бактерий, стимулирующих рост растений: фиксация азота, солюбизация фосфата, синтез сидерофоров. Перспективы разработки микробных консорциумов
Timofeevа, А. М., Galyamovа, М. R. & Sedykh, S. E., 2024, In: Агрохимия. 5, p. 85-95 11 p.
Research output: Contribution to journal › Article › peer-review
Биомолекулы. Ч. 1. Аминокислоты и белки
Красников, А. С., Мызина, С. Д. & Исакова, С. В. (ed.), 2024, ИПЦ НГУ. 202 p.
Research output: Book/Report › Teaching manual › peer-review
ВСТРЕЧАЕМОСТЬ СЕРОТИПОВ АДЕНОВИРУСА СРЕДИ СЛУЧАЕВ ОРЗ В ГОРОДЕ ТАШКЕНТЕ РЕСПУБЛИКИ УЗБЕКИСТАН
Демина, Д. С., Бердиева, С. Б., Осипов, И. Д., Маслов, Д. Е., Васиховская, В. А., Забелина, Д. С., Рузметова, С. И., Камолходжаев, Д. А., Ибадуллаева, Н. С., Хикматуллаева, А. С., Мусабаев, Э. И., Кушакова, Д. Ш., Аглетдинов, Э. Ф. & Нетёсов, С. В., 2024, p. 39.
Research output: Contribution to conference › Abstract
ГЕНЕТИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ АДЕНОВИРУСОВ СРЕДИ ПАЦИЕНТОВ В ГОРОДЕ ТАШКЕНТ РЕСПУБЛИКИ УЗБЕКИСТАН С ДИАГНОЗОМ ОРЗ
Демина, Д. С., Бердиева, С. Б., Осипов, И. Д., Маслов, Д. Е., Васиховская, В. А., Забелина, Д. С., Рузметова, С. И., Камолходжаев, Д. А., Ибадуллаева, Н. С., Хикматуллаева, А. С., Мусабаев, Э. И., Кушакова, Д. Ш., Аглетдинов, Э. Ф. & Нетёсов, С. В., 2024, p. 60.
Research output: Contribution to conference › Abstract
ГЕНЕТИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ АДЕНОВИРУСОВ СРЕДИ ПАЦИЕНТОВ ГБУЗ НСО «ГИКБ № 1» И ГБУЗ НСО «ДГКБ № 3» г. НОВОСИБИРСКА С ДИАГНОЗОМ ОРЗ
Демина, Д. С., Бердиева, С. Б., Осипов, И. Д., Маслов, Д. Е., Комиссарова, Т. В., Макуха, В. В., Позднякова, Л. Л., Ульянова, Я. С., Томилова, Ю. Э., Аглетдинов, Э. Ф. & Нетёсов, С. В., 2024, p. 224-225. 1 p.
Research output: Contribution to conference › Abstract
Модифицированные фоторасщепляемые направляющие РНК для создания регулируемой системы CRISPR/Cas9
Саковина, Л. В., Горленко, Е. С., Жарков, Д. О. & Новопашина, Д. С., 2024, p. 68-69. 2 p.
Research output: Contribution to conference › Abstract
Молекулярно-генетический анализ персональных культур клеток увеальной меланомы
Zhilnikova, M. V., Atamanov, V. V., Zvereva, S. P., Gayner, T. A., Boyarskikh, U. A., Stanishevskaya, O. M., Chernykh, D. V., Kononova, N. V. & Koval', O. A., 2024, In: Fyodorov Journal of Ophthalmic Surgery. 140, 2s, p. 63-71 9 p., 8.
Research output: Contribution to journal › Article › peer-review
Основы белковой инженерии
Юдкина, А. В., Петрова, Д. В., Торгашева, Н. А., Вохтанцев, И. П., Дятлова, Е. А., Ендуткин, А. В., Байков, И. К., Дворникова, А. П. & Жарков, Д. О., 2024, Новосибирск: ИПЦ НГУ. 214 p.
Research output: Book/Report › Teaching materials › peer-review
Регуляция активности систем CRISPR/Cas9 на уровне направляющих РНК
Новопашина, Д. С., Горленко, Е. С., Должикова, О. А., Саковина, Л. В. & Мещанинова, М. И., 2024, ФИЗИКО-ХИМИЧЕСКАЯ БИОЛОГИЯ: Материалы V всероссийской конференции, приуроченной к 40-летию ИХБФМ СО РАН. Новосибирск: ООО "Офсет ТМ", p. 70
Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceeding › Conference contribution › Research
Репликация ДНК эукариот
Белоусова, Е. А. & Дымшиц, Г. М., 2024, Новосибирск: ИПЦ НГУ. 102 p.
Research output: Book/Report › Teaching manual › peer-review
Сборник задач и упражнений по молекулярной биологии
Грин, И. Р., Воробьев, П. Е., Вохтанцев, И. П., Коваль, В. В., Коваль, О. А. & Жарков, Д. О., 2024, 72 p.
Research output: Book/Report › Teaching manual
Точность действия ДНК-полимераз на поврежденных и неповрежденных ДНК-матрицах при синтезе с вытеснением цепи
Чуприкова, М. С., Яковлев, А. О., Затеева, М. В., Юдкина, А. В. & Жарков, Д. О., 2024, ФИЗИКО-ХИМИЧЕСКАЯ БИОЛОГИЯ: Материалы V всероссийской конференции, приуроченной к 40-летию ИХБФМ СО РАН. Новосибирск: ООО "Офсет ТМ", p. 51 1 p.
Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceeding › Conference contribution › Research
Фоторасщепляемые направляющие РНК для фоторегулируемой системы CRISPR/CAS9
Ахметова, Е., Вохтанцев, И. П., Мещанинова, М. И., Воробьева, М. А., Жарков, Д. О. & Новопашина, Д. С., 2024, In: Биоорганическая химия. 50, 4, p. 556-567 12 p.
Research output: Contribution to journal › Article › peer-review
Фоторегулируемые на уровне направляющей РНК системы CRISPR/Cas
Саковина, Л. В., Горленко, Е. С. & Новопашина, Д. С., 2024, In: Биофизика. 69, 3, p. 421-431 11 p.
Research output: Contribution to journal › Article › peer-review
Фоторегулируемые системы CRISPR/Cas9 с использованием фоточувствительных направляющих РНК
Горленко, Е. С., Саковина, Л. В. & Новопашина, Д. С., 2024, ФИЗИКО-ХИМИЧЕСКАЯ БИОЛОГИЯ: Материалы V всероссийской конференции, приуроченной к 40-летию ИХБФМ СО РАН. Новосибирск: ООО "Офсет ТМ", p. 87
Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceeding › Conference contribution › Research
2023
Expanding the list of sequence-agnostic enzymes for chromatin conformation capture assays with S1 nuclease
Maria, G., Andrey, P., Artem, S., Nikita, T., Andrey, K., Evgeny, K., Oxana, R., Maxim, F. & Veniamin, F., 11 Dec 2023, In: Epigenetics & chromatin. 16, 1, 13 p., 48.
Research output: Contribution to journal › Article › peer-review
Exosomal Cargo in Ovarian Cancer Dissemination
Dzhugashvili, E. & Tamkovich, S., 7 Dec 2023, In: Current issues in molecular biology. 45, 12, p. 9851-9867 17 p., 31.
Research output: Contribution to journal › Review article › peer-review
A New Human Uveal Melanoma Cell Line: Melanin Production and Molecular Markers for Targeted Therapy
Zhilnikova, M. V., Novak, D. D., Troitskaya, O. S., Nushtaeva, A. A., Biryukov, M. M., Zvereva, S. P., Varlamov, M. E., Koval, V. V., Stanishevskaya, O. M., Chernikh, D. V., Kononova, N. V., Atamanov, V. V. & Koval, O. A., Dec 2023, In: Biochemistry (Moscow) Supplement Series B: Biomedical Chemistry. 17, 4, p. 165-171 7 p.
Research output: Contribution to journal › Article › peer-review
A Novel Podophage StenR_269 Suggests a New Family in the Class Caudoviricetes
Yakubovskij, V. I., Morozova, V. V., Kozlova, Y. N., Tikunov, A. Y., Babkin, I. V., Bardasheva, A. V., Zhirakovskaya, E. V., Baykov, I. K., Kaverina, G. B. & Tikunova, N. V., Dec 2023, In: Viruses. 15, 12, 2437.
Research output: Contribution to journal › Article › peer-review
Blood Plasma Circulating DNA-Protein Complexes: Involvement in Carcinogenesis and Prospects for Liquid Biopsy of Breast Cancer
Shefer, A., Tutanov, O., Belenikin, M., Tsentalovich, Y. P. & Tamkovich, S., Dec 2023, In: Journal of Personalized Medicine. 13, 12, 1691.
Research output: Contribution to journal › Article › peer-review
Hydrolysis of Oligodeoxyribonucleotides on the Microarray Surface and in Solution by Catalytic Anti-DNA Antibodies in Systemic Lupus Erythematosus
Novikova, T. S., Ermakov, E. A., Kostina, E. V., Sinyakov, A. N., Sizikov, A. E., Nevinsky, G. A. & Buneva, V. N., Dec 2023, In: Current issues in molecular biology. 45, 12, p. 9887-9903 17 p.
Research output: Contribution to journal › Article › peer-review
Plant Growth-Promoting Bacteria of Soil: Designing of Consortia Beneficial for Crop Production
Timofeeva, A. M., Galyamova, M. R. & Sedykh, S. E., Dec 2023, In: Microorganisms. 11, 12, 2864.
Research output: Contribution to journal › Review article › peer-review
Plant Growth-Promoting Soil Bacteria: Nitrogen Fixation, Phosphate Solubilization, Siderophore Production, and Other Biological Activities
Timofeeva, A. M., Галямова, М. Р. & Sedykh, S. E., Dec 2023, In: Plants. 12, 24, 4074.
Research output: Contribution to journal › Review article › peer-review
Self-Penetrating Oligonucleotide Derivatives: Features of Self-Assembly and Interactions with Serum and Intracellular Proteins
Bauer, I., Ilina, E., Zharkov, T., Grigorieva, E., Chinak, O., Kupryushkin, M., Golyshev, V., Mitin, D., Chubarov, A., Khodyreva, S. & Dmitrienko, E., Dec 2023, In: Pharmaceutics. 15, 12, 2779.
Research output: Contribution to journal › Article › peer-review
Pharmacokinetic study of Tdp1 inhibitor resulted in a significant increase in antitumor effect in the treatment of Lewis lung carcinoma in mice by its combination with topotecan
Okhina, A. A., Kornienko, T. E., Rogachev, A. D., Luzina, O. A., Popova, N. A., Nikolin, V. P., Zakharenko, A. L., Dyrkheeva, N. S., Pokrovsky, A. G., Salakhutdinov, N. F. & Lavrik, O. I., 30 Nov 2023, In: Journal of Pharmaceutical and Biomedical Analysis. 236, 9 p., 115731.
Research output: Contribution to journal › Article › peer-review
Cas9 is mostly orthogonal to human systems of DNA break sensing and repair
Maltseva, E. A., Vasil'eva, I. A., Moor, N. A., Kim, D. V., Dyrkheeva, N. S., Kutuzov, M. M., Vokhtantsev, I. P., Kulishova, L. M., Zharkov, D. O. & Lavrik, O. I., 29 Nov 2023, In: PLoS ONE. 18, 11, 26 p., e0294683.
Research output: Contribution to journal › Article › peer-review
Integration of fluorescence in situ hybridization and chromosome-length genome assemblies revealed synteny map for guinea pig, naked mole-rat, and human
Romanenko, S. A., Kliver, S. F., Serdyukova, N. A., Perelman, P. L., Trifonov, V. A., Seluanov, A., Gorbunova, V., Azpurua, J., Pereira, J. C., Ferguson-Smith, M. A. & Graphodatsky, A. S., 29 Nov 2023, In: Scientific Reports. 13, 1, 12 p., 21055.
Research output: Contribution to journal › Article › peer-review
BRACNAC: A BRCA1 and BRCA2 Copy Number Alteration Caller from Next-Generation Sequencing Data
Kechin, A., Boyarskikh, U., Borobova, V., Khrapov, E., Subbotin, S. & Filipenko, M., 22 Nov 2023, In: International Journal of Molecular Sciences. 24, 23, 16630.
Research output: Contribution to journal › Article › peer-review
A comparative investigation of equimolar Ni-, Ru-, Rh- and Pt-based composite structured catalysts for energy-efficient methane reforming
Ruban, N. V., Rogozhnikov, V. N., Stonkus, O. A., Emelyanov, V. A., Pakharukova, V. P., Svintsitskiy, D. A., Zazhigalov, S. V., Zagoruiko, A. N., Snytnikov, P. V., Sobyanin, V. A. & Potemkin, D. I., 15 Nov 2023, In: Fuel. 352, 14 p., 128973.
Research output: Contribution to journal › Article › peer-review
Methods for Assessment of Nucleotide Excision Repair Efficiency
Popov, A. A., Petruseva, I. O., Naumenko, N. V. & Lavrik, O. I., Nov 2023, In: Biochemistry (Moscow). 88, 11, p. 1844-1856 13 p.
Research output: Contribution to journal › Review article › peer-review
Response of PRIMPOL-Knockout Human Lung Adenocarcinoma A549 Cells to Genotoxic Stress
Gromova, A. S., Boldinova, E. O., Kim, D. V., Chuprov-Netochin, R. N., Leonov, S. V., Pustovalova, M. V., Zharkov, D. O. & Makarova, A. V., Nov 2023, In: Biochemistry (Moscow). 88, 11, p. 1933-1943 11 p.
Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

Previous 1 2 3 4 5 6 7 8 ...22 Next

ID: 3083609