1. 2026
  2. AIMarkerFinder: AI-Assisted Marker Discovery Based on an Integrated Approach of Autoencoders and Kolmogorov–Arnold Networks

    Demenkov, P. S., Ivanisenko, T. V. & Ivanisenko, V. A., 2026, In: Informatics. 13, 1, 13 p., 2.

    Research output: Contribution to journalArticlepeer-review

  3. 2025
  4. Программа для определения взаимного влияния лекарств «Безопасные лекарства»

    Иванисенко, В. А., Иванисенко, Т. В., Яцык, И. В. & Деменков, П. С., 17 Dec 2025, Роспатент - Федеральная служба по интеллектуальной собственности, Patent No. 2025696239, 4 Dec 2025, Priority date 4 Dec 2025, Priority No. 2025695254

    Research output: PatentSoftware registration

  5. Hierarchical Classification of Scientific Articles Using Deep Learning (Using the UDC Hierarchy As an Example)

    Мамедов, В. Ю., Ковалевский, Д. А., Морозов, Д. А., Столяров, С. С. & Оспичев, С. С., Dec 2025, In: Automatic Control and Computer Sciences. 59, 7, p. 1181-1192 12 p.

    Research output: Contribution to journalArticlepeer-review

  6. База данных влияния факторов повышенной утомляемости, характерных для городской среды, на молекулярно-генетические и фенотипические характеристики организма человека

    Иванисенко, В. А., Иванисенко, Т. В., Яцык, И. В. & Деменков, П. С., 19 Nov 2025, Роспатент - Федеральная служба по интеллектуальной собственности, Patent No. 2025625300, 29 Oct 2025, Priority date 29 Oct 2025, Priority No. 2025624676

    Research output: PatentDatabase registration

  7. База данных влияния бессонницы, характерной для городской среды, на молекулярно- генетические и фенотипические характеристики организма человека

    Иванисенко, В. А., Иванисенко, Т. В., Яцык, И. В. & Деменков, П. С., 11 Nov 2025, Роспатент - Федеральная служба по интеллектуальной собственности, Patent No. 2025625017, 29 Oct 2025, Priority date 29 Oct 2025, Priority No. 2025624647

    Research output: PatentDatabase registration

  8. База данных влияния гипоксии, связанной с условиями жизни в городской среде, на молекулярно-генетические, физиологические и фенотипические характеристики организма человека

    Иванисенко, В. А., Иванисенко, Т. В., Яцык, И. В. & Деменков, П. С., 6 Nov 2025, Роспатент - Федеральная служба по интеллектуальной собственности, Patent No. 2025624919, 29 Oct 2025, Priority date 29 Oct 2025, Priority No. 2025624660

    Research output: PatentDatabase registration

  9. Classification of λ-homomorphic braces on ℤ2

    Nasybullov, T. & Novikov, I., 10 May 2025, In: Communications in Algebra. 53, 11, p. 4695-4709 15 p.

    Research output: Contribution to journalArticlepeer-review

  10. Isomorphism of Atomless Boolean Algebras with Distinguished Ideals

    Goncharov, S. S. & Xiang, J., 29 Apr 2025, In: Algebra and Logic. 63, 3, p. 179–185 7 p.

    Research output: Contribution to journalArticlepeer-review

  11. Metabolomic and gene networks approaches reveal the role of mitochondrial membrane proteins in response of human melanoma cells to THz radiation

    Butikova, E. A., Basov, N. V., Rogachev, A. D., Gaisler, E. V., Ivanisenko, V. A., Demenkov, P. S., Makarova, A. L. A., Ivanisenko, T. V., Razumov, I. A., Kolomeyets, D. A., Cheresiz, S. V., Solovieva, O. I., Larionov, K. P., Sotnikova, Y. S., Patrushev, Y. V., Kolchanov, N. A., Pokrovsky, A. G., Vinokurov, N. A., Kanygin, V. V., Popik, V. M., & 1 othersShevchenko, O. A., Mar 2025, In: Biochimica et Biophysica Acta - Molecular and Cell Biology of Lipids. 1870, 2, 17 p., 159595.

    Research output: Contribution to journalArticlepeer-review

  12. On additive differential probabilities of the composition of bitwise exclusive-or and a bit rotation

    Kolomeec, N., Sutormin, I., Bykov, D., Panferov, M. & Bonich, T., Mar 2025, In: Cryptography and Communications. 17, 2, p. 541-570 30 p., 3.

    Research output: Contribution to journalArticlepeer-review

  13. Программный комплекс для использования процедурной генерации в компьютерной игре вида «платформер»

    Алешков, Д. О., Анищенко, А. И., Бобровский, Я. А., Гринин, А. А., Дитенбир, А. А., Марченко, А. Е., Тютюнникова, М. Е., Ускова, Т. В. & Шигин, Ф. В., 20 Jan 2025, Роспатент - Федеральная служба по интеллектуальной собственности, Patent No. 2025611394, 23 Dec 2024, Priority date 23 Dec 2024, Priority No. 2024693171

    Research output: PatentSoftware registration

  14. Фреймворк «Каппа»: управление датасетами, версия 1.0.0

    Кумар, Р., Павловский, Е., Денисов, С. С., Иванков, П. С. & Мищенко, А. С., 16 Jan 2025, Роспатент - Федеральная служба по интеллектуальной собственности, Patent No. 2025611211, 18 Dec 2024, Priority date 18 Dec 2024, Priority No. 2024692636

    Research output: PatentSoftware registration

  15. Датасет по наблюдениям за флорой и фауной в городской среде

    Гичгелдиева, М. О., Кумар, Р. & Павловский, Е., 10 Jan 2025, Роспатент - Федеральная служба по интеллектуальной собственности, Patent No. 2025620139, 17 Dec 2024, Priority date 17 Dec 2024, Priority No. 2024626457

    Research output: PatentDatabase registration

  16. Программный комплекс для восстановления трехмерной структуры поверхностной бедренной артерии человека на основе ультразвуковой диагностики

    Тарасов, К. О., Епифанов, Р. Ю., Гостев, А. А., Лысиков, Д. А., Карпенко, А. А. & Мулляджанов, Р. И., 9 Jan 2025, Роспатент - Федеральная служба по интеллектуальной собственности, Patent No. 2025610181, 16 Dec 2024, Priority date 16 Dec 2024, Priority No. 2024691869

    Research output: PatentSoftware registration

  17. An Explanation Method for Semantic Segmentation Enhance Brain Tumor Classification

    Kenzhin, R., Luu, M. S. K., Pavlovskiy, E. & Tuchinov, B., 2025, Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics) . Springer, p. 319-330 12 p. 23. (Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics) ; vol. 15406 LNCS).

    Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceedingConference contributionResearchpeer-review

  18. Computational Complexity of the Choice Problem for Typical Representatives of a Finite Point Set in a Metric Space

    Борисова, И. А., 2025, In: Journal of Applied and Industrial Mathematics. 19, 1, p. 1-6 6 p., 1.

    Research output: Contribution to journalArticlepeer-review

  19. MiceDEGdb: a knowledge base on differentially expressed mouse genes as a model object in biomedical research

    Podkolodnaya, O. A., Chadaeva, I. V., Filonov, S. V., Podkolodnyy, N. L., Rasskazov, D. A., Tverdokhleb, N. N., Zolotareva, K. A., Bogomolov, A. G., Kondratyuk, E. Y., Oshchepkov, D. Y. & Ponomarenko, M. P., 2025, In: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 29, 1, p. 153-161 9 p.

    Research output: Contribution to journalArticlepeer-review

  20. The Task-Based Approach: A New Paradigm for Building Trustworthy Artificial Intelligence

    Nechesov, A. V., Vityaev, E. E., Goncharov, S. S. & Sviridenko, D. I., 2025, In: Bulletin of Irkutsk State University, Series Mathematics. 54, p. 96-112 17 p., 7.

    Research output: Contribution to journalArticlepeer-review

  21. Иерархическая классификация научных статей при помощи глубокого обучения (на примере иерархии УДК)

    Mamedov, V. Y., Kovalevsky, D. A., Morozov, D., Stolyarov, S. S. & Ospichev, S. S., 2025, In: Modeling and Analysis of Information Systems. 32, 1, p. 80-94 15 p., 6.

    Research output: Contribution to journalArticlepeer-review

  22. Реконструкция и анализ генной сети регуляции апоптоза при гепатоцеллюлярной карциноме на основе данных scRNA-seq и базы знаний ANDSystem

    Adamovskaya, A. V., Yatsyk, I. V., Kleshchev, M. A., Demenkov, P. S., Ivanisenko, T. V. & Ivanisenko, V. A., 2025, In: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 29, 7, p. 963-977 15 p., 5.

    Research output: Contribution to journalArticlepeer-review

  23. 2024
  24. Графический интерфейс для работы с фреймворком Каппа версии 0.0.2

    Кумар, Р., Павловский, Е. & Болотов, К. Ю., 10 Dec 2024, Редакционно-издательский центр НГУ, Patent No. 113, 10 Dec 2024, Priority date 10 Dec 2024

    Research output: PatentKnow-how registration

  25. Candidate SNP Markers Significantly Altering the Affinity of the TATA-Binding Protein for the Promoters of Human Genes Associated with Primary Open-Angle Glaucoma

    Zolotareva, K., Dotsenko, P. A., Podkolodnyy, N., Ivanov, R., Makarova, A. L., Chadaeva, I., Bogomolov, A., Demenkov, P. S., Ivanisenko, V., Oshchepkov, D. & Ponomarenko, M., Dec 2024, In: International Journal of Molecular Sciences. 25, 23, 12802.

    Research output: Contribution to journalArticlepeer-review

  26. Computational identification of promising genetic markers associated with molecular mechanisms of reduced rice resistance to Rhizoctonia solani under excess nitrogen fertilization using gene network reconstruction and analysis methods

    Antropova, E. A., Volyanskaya, A. R., Adamovskaya, A. V., Demenkov, P. S., Yatsyk, I. V., Ivanisenko, T. V., Orlov, Y. L., Haoyu, C., Chen, M. & Ivanisenko, V. A., Dec 2024, In: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 28, 8, p. 960-973 14 p.

    Research output: Contribution to journalArticlepeer-review

  27. Could SLC26A7 Be a Promising Marker for Preoperative Diagnosis of High-Grade Papillary Thyroid Carcinoma?

    Titov, S. E., Kozorezova, E. S., Lukyanov, S. A., Sergiyko, S. V., Demenkov, P. S., Veryaskina, Y. A., Vorobyev, S. L., Sleptsov, I. V., Chernikov, R. A., Timofeeva, N. I., Barashkova, S. V., Lushnikova, E. L., Uspenskaya, A. A., Zolotoukho, A. V., Romanova, O. V. & Zhimulev, I. F., Dec 2024, In: Diagnostics. 14, 23, 2652.

    Research output: Contribution to journalArticlepeer-review

  28. Gene networks and metabolomic screening analysis revealed specific pathways of amino acid and acylcarnitine profile alterations in blood plasma of patients with Parkinson’s disease and vascular parkinsonism

    Makarova, A. A., Melnikova, P. M., Rogachev, A. D., Demenkov, P. S., Ivanisenko, T. V., Predtechenskaya, E. V., Karmanov, S. Y., Koval, V. V., Pokrovsky, A. G., Lavrik, I. N., Kolchanov, N. A. & Ivanisenko, V. A., Dec 2024, In: Вавиловский журнал генетики и селекции. 28, 8, p. 927-939 13 p.

    Research output: Contribution to journalArticlepeer-review

  29. Investigation of metabolic features of glioblastoma tissue and the peritumoral environment using targeted metabolomics screening by LC-MS/MS and gene network analysis

    Basov, N. V., Adamovskaya, A. V., Rogachev, A. D., Gaisler, E. V., Demenkov, P. S., Ivanisenko, T. V., Venzel, A. S., Mishinov, S. V., Stupak, V. V., Cheresiz, S. V., Oleshko, O. S., Butikova, E. A., Osechkova, A. E., Sotnikova, Y. S., Patrushev, Y. V., Pozdnyakov, A. S., Lavrik, I. N., Ivanisenko, V. A. & Pokrovsky, A. G., Dec 2024, In: Вавиловский журнал генетики и селекции. 28, 8, p. 882-896 15 p.

    Research output: Contribution to journalArticlepeer-review

  30. Orthoweb: a software package for evolutionary analysis of gene networks

    Ivanov, R. A., Mukhin, A. M., Kazantsev, F. V., Mustafin, Z. S., Afonnikov, D. A., Matushkin, Y. G. & Lashin, S. A., Dec 2024, In: Вавиловский журнал генетики и селекции. 28, 8, p. 874-881 8 p.

    Research output: Contribution to journalArticlepeer-review

  31. Reconstruction and computational analysis of the microRNA regulation gene network in wheat drought response mechanisms

    Kleshchev, M. A., Maltseva, A. V., Antropova, E. A., Demenkov, P. S., Ivanisenko, T. V., Orlov, Y. L., Chao, H., Chen, M., Kolchanov, N. A. & Ivanisenko, V. A., Dec 2024, In: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 28, 8, p. 904-917 14 p.

    Research output: Contribution to journalArticlepeer-review

  32. Reconstruction and computer analysis of the structural and functional organization of the gene network regulating cholesterol biosynthesis in humans and the evolutionary characteristics of the genes involved in the network

    Mikhailova, A. D., Lashin, S. A., Ivanisenko, V. A., Demenkov, P. S. & Игнатьева, Е. В., Dec 2024, In: Вавиловский журнал генетики и селекции. 28, 8, p. 864-873 10 p.

    Research output: Contribution to journalArticlepeer-review

  33. An Accurate and Efficient Approach to Knowledge Extraction from Scientific Publications Using Structured Ontology Models, Graph Neural Networks, and Large Language Models

    Ivanisenko, T. V., Demenkov, P. S. & Ivanisenko, V. A., 3 Nov 2024, In: International Journal of Molecular Sciences. 25, 21, 11811.

    Research output: Contribution to journalArticlepeer-review

  34. AI-Assisted Identification of Primary and Secondary Metabolomic Markers for Postoperative Delirium

    Ivanisenko, V. A., Rogachev, A. D., Makarova, A-L. A., Basov, N. V., Gaisler, E. V., Kuzmicheva, I. N., Demenkov, P. S., Venzel, A. S., Ivanisenko, T. V., Antropova, E. A., Kolchanov, N. A., Plesko, V. V., Moroz, G. B., Lomivorotov, V. V. & Pokrovsky, A. G., Nov 2024, In: International Journal of Molecular Sciences. 25, 21, 11847.

    Research output: Contribution to journalArticlepeer-review

  35. A programmable ultrasound-based system for reconstructing the three-dimensional structure of the superficial femoral artery

    Tarasov, K. O., Epifanov, R. U. I., Gostev, A. A., Lysikov, D. A., Karpenko, A. A. & Mullyadzhanov, R. I., Sept 2024, In: Biomedical Engineering. 58, 3, p. 158-162 5 p.

    Research output: Contribution to journalArticlepeer-review

  36. Computable Boolean Algebras and Complexity of the Fréchet Ideal

    Goncharov, S. S., Sept 2024, In: Journal of Mathematical Sciences (United States). 284, 1, p. 72-82 11 p.

    Research output: Contribution to journalArticlepeer-review

  37. Чат бот и облачный сервис составления личных расписаний участников крупных мультиязычных мероприятий на основе интеллектуального анализа их предпочтений и компетенций

    Павловский, Е. & Тучинов, Б. Н., 27 Aug 2024, Роспатент - Федеральная служба по интеллектуальной собственности, Patent No. 2024680238, 20 Aug 2024, Priority date 20 Aug 2024, Priority No. 2024669513

    Research output: PatentSoftware registration

  38. SmartCrop cognitive platform: modules for automatic knowledge extraction from scientific publications, patents and factual databases for reconstruction and analysis of gene networks of stress response in rice and wheat

    Иванисенко, В. А., Деменков, П. С., Иванисенко, Т. В., Антропова, Е. А., Волянская, А. Р., Зубаирова, У. С., Макарова, А-Л. А., Орлов, Ю. Л. & Chen, M., Aug 2024, Bioinformatics of Genome Regulation and Structure Systems Biology (BGRS/SB-2024): The 14th International Multiconference (05-10 August 2024, Novosibirsk, Russia). Новосибирск: Институт цитологии и генетики СО РАН, p. 2188-2190 3 p.

    Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceedingConference contributionResearchpeer-review

  39. Prediction of the Aggressive Clinical Course of Papillary Thyroid Carcinoma Based on Fine Needle Aspiration Biopsy Molecular Testing

    Lukyanov, S. A., Titov, S. E., Kozorezova, E. S., Demenkov, P. S., Veryaskina, Y. A., Korotovskii, D. V., Ilyina, T. E., Vorobyev, S. L., Zhivotov, V. A., Bondarev, N. S., Sleptsov, I. V. & Sergiyko, S. V., Jul 2024, In: International Journal of Molecular Sciences. 25, 13, 14 p., 7090.

    Research output: Contribution to journalArticlepeer-review

  40. A Principal Components Analysis and Functional Annotation of Differentially Expressed Genes in Brain Regions of Gray Rats Selected for Tame or Aggressive Behavior

    Chadaeva, I., Kozhemyakina, R., Shikhevich, S., Bogomolov, A., Kondratyuk, E., Ощепков, Д. Ю., Orlov, Y. L. & Markel, A. L., May 2024, In: International Journal of Molecular Sciences. 25, 9, 16 p., 4613.

    Research output: Contribution to journalArticlepeer-review

  41. Система распознавания речевых команд в клиент-серверной архитектуре на базе глубоких нейросетей с возможностью быстрой (без обучения) адаптации под специализированные словари команд

    Бондаренко, И., Мартиросян, С. А., Гребенкин, Д. В., Кондрашук, В. В., Болдинов, А. К. & Паульс, А. Е., 5 Feb 2024, Роспатент - Федеральная служба по интеллектуальной собственности, Patent No. 2024612715, 22 Jan 2024, Priority date 22 Jan 2024, Priority No. 2024610873

    Research output: PatentSoftware registration

  42. Harnessing Ensemble Machine Learning Models for Timely Diagnosis of Breast Cancer Metastasis: A Case Study on CatBoost, XGBoost, and LGBM

    Luu, M. S. K., Banerjee, S., Pavlovskiy, E. N. & Tuchinov, B. N., 2024, International Conference of Young Specialists on Micro/Nanotechnologies and Electron Devices, EDM. IEEE Computer Society, p. 2320-2325 6 p. (International Conference of Young Specialists on Micro/Nanotechnologies and Electron Devices, EDM).

    Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceedingConference contributionResearchpeer-review

  43. Сравнительная молекулярная оценка неизмененной слизистой оболочки сегментов толстой кишки как возможной основы аденом

    Korotkevich, A. G., Zhilina, N. M., Demenkov, P. S., Veryaskina, Y. A. & Titov, S. E., 2024, In: Экспериментальная и клиническая гастроэнтерология. 4 (224), p. 20-29 10 p., 3.

    Research output: Contribution to journalArticlepeer-review

  44. Технология искусственного интеллекта для предоперационного анализа МРТ-изображений в нейроонкологии

    Летягин, А. Ю., Голушко, С. К., Рзаев, Д. А. О., Амелина, Е. В., Павловский, Е., Тучинов, Б. Н., Гроза, В. В., Амелин, М. Е. & Толстокулаков, Н. Ю., 2024, Новосибирск: ФГУП "Издательство СО РАН". 88 p.

    Research output: Book/ReportBookResearchpeer-review

  45. 2023
  46. Программа расшифровки аббревиатур сущностей в рефератах научных публикаций на основе их контекста (ЭНДДекрипт) / Program for decoding entity abbreviations in abstracts of scientific publications based on their context (ANDDecrypt)

    Иванисенко, Т. В., Деменков, П. С. & Иванисенко, В. А., 8 Dec 2023, Роспатент - Федеральная служба по интеллектуальной собственности, Patent No. 2023686851, 16 Nov 2023, Priority date 16 Nov 2023, Priority No. 2023684403

    Research output: PatentSoftware registration

  47. Gene networks for use in metabolomic data analysis of blood plasma from patients with postoperative delirium

    Ivanisenko, V. A., Basov, N. V., Makarova, A. A., Venzel, A. S., Rogachev, A. D., Demenkov, P. S., Ivanisenko, T. V., Kleshchev, M. A., Gaisler, E. V., Moroz, G. B., Plesko, V. V., Sotnikova, Y. S., Patrushev, Y. V., Lomivorotov, V. V., Kolchanov, N. A. & Pokrovsky, A. G., Dec 2023, In: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 27, 7, p. 768-775 8 p.

    Research output: Contribution to journalArticlepeer-review

  48. Molecular-genetic pathways of hepatitis C virus regulation of the expression of cellular factors PREB and PLA2G4C, which play an important role in virus replication

    Mishchenko, E. L., Makarova, A. A., Antropova, E. A., Venzel, A. S., Ivanisenko, T. V., Demenkov, P. S. & Ivanisenko, V. A., Dec 2023, In: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 27, 7, p. 776-783 8 p.

    Research output: Contribution to journalArticlepeer-review

  49. Prioritization of potential pharmacological targets for the development of anti-hepatocarcinoma drugs modulating the extrinsic apoptosis pathway: the reconstruction and analysis of associative gene networks help

    Demenkov, P. S., Antropova, E. A., Adamovskaya, A. V., Mishchenko, E. L., Khlebodarova, T. M., Ivanisenko, T. V., Ivanisenko, N. V., Venzel, A. S., Lavrik, I. N. & Ivanisenko, V. A., Dec 2023, In: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 27, 7, p. 784-793 10 p.

    Research output: Contribution to journalArticlepeer-review

  50. Accurate noise-robust classification of Bacillus species from MALDI-TOF MS spectra using a denoising autoencoder

    Uvarova, Y. E., Demenkov, P. S., Kuzmicheva, I. N., Venzel, A. S., Mischenko, E. L., Ivanisenko, T. V., Efimov, V. M., Bannikova, S. V., Vasilieva, A. R., Ivanisenko, V. A. & Peltek, S. E., 1 Sept 2023, In: Journal of integrative bioinformatics. 20, 3, 12 p.

    Research output: Contribution to journalArticlepeer-review

Previous 1 2 3 Next

ID: 60174729